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Table 3 Significant VIP variants in the Wa people compared with the other 26 populations after Bonferroni’s multiple adjustment

From: Genetic analysis of pharmacogenomic VIP variants in the Wa population from Yunnan Province of China

SNP ID

Genes

p < 0.05/(52×26)

EAS

AFR

AMR

EUR

SAS

CDX

CHB

CHS

JPT

KHV

ACB

ASW

ESN

GWD

LWK

MSL

YRI

CLM

MXL

PEL

PUR

CEU

FIN

GBR

IBS

TSI

BEB

GIH

ITU

PJL

STU

rs11572325

CYP2J2

     

1.02E-06*

5.45E-06*

1.90E-06*

4.42E-06*

2.08E-05*

8.09E-05

2.75E-06*

   

7.76E-06*

 

6.62E-05

        

rs10889160

CYP2J2

   

0.000294

 

5.88E-19*

1.08E-10*

1.52E-21*

8.72E-15*

1.62E-16*

9.67E-19*

4.46E-21*

   

0.000148

 

9.14E-06*

        

rs1760217

DPYD

     

0.00083

  

1.07E-05*

  

5.51E-05

0.000265

  

3.19E-06*

 

2.18E-05*

5.35E-05

0.000223

0.00048

  

9.86E-09*

1.1E-05*

3.54E-08*

rs1801159

DPYD

        

6.33E-08*

 

3.62E-07*

   

2.14E-06*

  

0.000829

   

1.76E-05*

8.42E-06*

4.32E-10*

3.16E-06*

2.57E-08*

rs1801265

DPYD

     

1.55E-14*

9.57E-19*

7.19E-19*

7.68E-22*

2.18E-22*

1.8E-14*

5.2E-20*

1.97E-05*

3.98E-05

 

8.12E-07*

 

2.03E-09*

 

0.000166

0.000112

 

5.32E-12*

3.1E-10*

5.62E-09*

 

rs5275

PTGS2

     

5.37E-24*

3.85E-17*

2.15E-28*

4.85E-23*

3.89E-24*

6.6E-27*

1.08E-28*

2.24E-08*

7.96E-06*

4.18E-08*

7.32E-05

9.47E-08*

 

0.000783

2.2E-05*

0.00027

3.18E-08*

8.54E-08*

1.31E-06*

2.86E-13*

7.33E-09*

rs20417

PTGS2

     

5.38E-29*

1.81E-26*

1.16E-37*

3.26E-27*

2.82E-24*

3.93E-36*

5.95E-33*

2.31E-19*

3.44E-19*

6.57E-17*

1.57E-18*

5.14E-15*

2.82E-09*

2.64E-12*

2.26E-13*

2.04E-16*

1.85E-15*

1.81E-15*

1.45E-14*

1.54E-19*

8.50E-18*

rs12139527

CACNA1S

     

9.11E-34*

1.29E-29*

1.83E-41*

2.75E-43*

5.74E-36*

7.83E-41*

3.31E-41*

   

4.94E-08

          

rs3850625

CACNA1S

            

9.08E-10*

 

4.71E-09*

 

2.62E-07*

4.14E-16*

2.62E-12*

1.13E-07*

4.73E-09*

5.03E-13*

4.51E-25*

2.99E-17*

4.65E-16*

1.61E-13*

rs2306238

RYR2

     

2.93E-06*

 

7.38E-09*

1.07E-07*

5.88E-07*

5.76E-08*

3.11E-07*

  

0.00071

           

rs2231142

ABCG2

    

0.000366

2.96E-09*

 

8.53E-11*

3.58E-10*

8.53E-11*

1.12E-07*

1.3E-11*

       

0.000186

2.64E-05*

 

0.000176

   

rs2231137

ABCG2

 

2.53E-07*

1.1E-05*

4.49E-17*

 

3.93E-29*

6.69E-25*

2.4E-29*

2.26E-33*

1.72E-21*

2.4E-22*

4.17E-30*

4.32E-18*

2.82E-10*

 

1.26E-18*

1.43E-31*

2.87E-24*

2.14E-30*

1.47E-30*

7.16E-27*

1.36E-10*

7.44E-19*

9.18E-24*

1.79E-22*

1.55E-14*

rs698

ADH1C

            

6.41E-05

1.92E-07*

 

2.17E-14*

1.65E-21*

1.19E-20*

1.04E-15*

1.26E-08*

1.53E-09*

0.000641

2.3E-07*

4.56E-06*

8.44E-11*

6.86E-12*

rs776746

CYP3A5

1.44E-20*

1.5E-18*

1.25E-18*

1.82E-21*

5.24E-21*

1.18E-37*

1.94E-33*

3.9E-43*

2.02E-40*

2.85E-40*

8.23E-39*

4.59E-45*

2.21E-13*

9.13E-17*

1.43E-09*

1.67E-14*

4.33E-06*

2.47E-06*

6.55E-07*

8.03E-08*

3.2E-07*

3.69E-22*

3.61E-20*

5.26E-21*

1.44E-19*

1.24E-20*

rs2242480

CYP3A4

     

2.62E-23*

1.64E-15*

3.89E-36*

1.69E-28*

1.47E-36*

6.57E-33*

1.5E-30*

  

1.35E-07*

 

6.01E-14*

3.6E-12*

5.94E-12*

2.02E-09*

1.22E-11*

     

rs1805123

KCNH2

            

0.000824

  

1.21E-05*

1.31E-06*

 

1.77E-07*

3.87E-08*

2.29E-09*

2.02E-09*

1.52E-06*

2.17E-08*

0.00023

2.36E-05*

rs4646244

NAT2

                      

0.00034

  

3.97E-05

rs4271002

NAT2

     

0.000159

 

3.3E-10*

3.72E-10

2.07E-05

0.000331

4.77E-06*

0.000636

   

1.74E-06*

      

0.000333

  

rs1041983

NAT2

              

1.66E-05*

 

0.000919

0.000817

        

rs1801280

NAT2

     

4.89E-14*

4.38E-14*

2.97E-14*

6.83E-19*

9.29E-22*

4.03E-11*

2.25E-11*

2.47E-21*

8.41E-19*

6.89E-15*

4.17E-22*

2.27E-25*

1.72E-27*

3.07E-27*

1.97E-30*

1.73E-26*

4.01E-19*

1.06E-18*

8.1E-20*

6.31E-25*

3.64E-15*

rs1799929

NAT2

     

4.69E-11*

5.21E-11*

1.75E-08*

1.49E-15*

8.89E-19*

9.21E-08*

2.85E-06*

4.54E-20*

4.43E-18*

3.32E-14*

2.5E-19*

3.12E-25*

5.32E-26*

9.84E-26*

2.87E-30*

1.73E-26*

6.28E-18*

3.27E-16*

5.98E-18*

9.49E-22*

3.69E-14*

rs1799930

NAT2

              

0.00019

       

0.000563

  

1.56E-05*

rs1208

NAT2

     

1.18E-20*

2.46E-17*

3.46E-22*

1.32E-27*

1.45E-27*

4.05E-19*

2.65E-22*

6.25E-22*

4.12E-23*

6.89E-15*

5E-22*

6.43E-24*

1.92E-25*

8.03E-26*

1.73E-30*

4.24E-27*

9.85E-22*

1.06E-18*

9.54E-20*

1.22E-25*

2.87E-17*

rs1799931

NAT2

   

0.000153

 

2.09E-08*

3.35E-05*

6.27E-11*

8.62E-12*

1.51E-11*

8.44E-07*

4.04E-09*

7.83E-06*

  

2.98E-05*

3.4E-12*

1.03E-08*

1.72E-09*

1.6E-09*

3.59E-11*

 

2.94E-07*

9.44E-07*

1.38E-06*

1.99E-05*

rs1495741

NAT2

 

3.08E-07*

 

5.51E-08*

               

5.75E-05

  

0.000771

 

6.3E-06*

7.45E-05

rs2115819

ALOX5

 

0.000363

   

1.65E-37*

8.62E-25*

4.45E-37*

5.67E-41*

9.79E-33*

1.05E-31*

5.94E-40*

3.77E-16*

9.55E-11*

9.96E-07*

1.12E-14*

5.62E-24*

3.92E-19*

3.07E-18*

6.98E-20*

8.9E-21*

9.03E-16*

6.62E-23*

1.72E-20*

9.48E-16*

2.24E-14*

rs4244285

CYP2C19

     

8.78E-08*

2.52E-06*

6.75E-05

3.23E-10*

0.00012

6.92E-06*

1.11E-07*

9.77E-11*

2.52E-07*

4.15E-14*

8.47E-10*

2.17E-09*

0.000117

5.20E-08*

7.41E-09*

4.51E-13*

     

rs1057910

CYP2C9

                      

5.21E-07*

0.000111

0.000272

 

rs11572103

CYP2C8

     

1.57E-16*

5.93E-10*

7.08E-15*

8.71E-19*

3.56E-09*

5E-12*

1.60E-14*

              

rs7909236

CYP2C8

            

6.35E-18*

1.175E-16*

1.77E-22*

1.7E-08*

1.45E-16*

3.59E-15*

1.16E-11*

3.98E-10*

2.96E-09*

1.61E-09*

3.5E-14*

3.03E-12*

1.49E-09*

3.17E-06*

rs17110453

CYP2C8

     

60E-20*

2.07E-14*

1.87E-20*

2.78E-24*

5.66E-22*

1.4E-19*

1.07E-22*

8.29E-11*

2.41E-07*

5.14E-14*

5.74E-10*

1.31E-11*

0.000358

6.93E-10*

0.000121

4.47E-11*

     

rs3813867

CYP2E1

 

3.59E-06

0.000102

0.000102

2.78E-06*

                     

rs2031920

CYP2E1

 

8.07E-05

  

0.0003

5.35E-05

 

3.99E-05

1.02E-05*

3.99E-05

0.000158

1.66E-05*

          

0.000331

0.000364

0.000634

0.000111

rs6413432

CYP2E1

4.21E-19*

1.31E-16*

1.45E-15*

3.14E-16*

1.66E-19*

   

0.000271

  

0.000531

6.57E-10*

4.59E-08*

9.02E-09*

2.97E-09*

1.63E-06*

1.26E-05

  

9.51E-05

8.46E-12*

1.83E-17*

7.76E-12*

9.13E-08*

2.51E-12*

rs2070676

CYP2E1

     

3.81E-30*

1.06E-17*

1E-28*

5.52E-30*

2.7E-35*

3.78E-31*

7.09E-28*

              

rs5219

KCNJ11

 

0.000522

   

4.08E-16*

5.26E-07*

1.86E-24*

2.18E-25*

1.16E-23*

7.22E-22*

4.56E-26*

6.22E-05

        

0.000384

0.000294

 

3.67E-07*

 

rs1801028

DRD2

                      

1.31E-13*

  

9.84E-09*

rs2306283

SLCO1B1

   

9.67E-06*

        

8.87E-16*

5.47E-20*

2.85E-16*

5.37E-13*

1.5E-21*

3.18E-19*

3.33E-24*

2.97E-22*

4.46E-25*

3.98E-10*

1.37E-11*

7.78E-09*

1.72E-17*

2.41E-11*

rs4516035

VDR

      

0.000251

     

1.88E-18*

9.22E-15*

3.1E-09*

7.2E-25*

2.88E-25*

7.28E-39*

1.17E-28*

3.93E-26*

4.94E-31*

1.74E-10*

3.7E-11*

1.81E-10*

1.72E-15*

7.16E-13*

rs762551

CYP1A2

       

0.000364

 

1.00E-05*

    

1.13E-05*

       

0.000511

  

2.42E-05*

rs2472304

CYP1A2

   

1.73E-05*

        

2.83E-16*

1.62E-07*

 

2.04E-24*

2.27E-36*

7.1E-29*

1.44E-34*

2.5E-33*

1.03E-26*

0.000626

  

2.56E-06*

 

rs750155

SULT1A1

        

0.00056

     

3.18E-23

      

0.000453

   

1.96E-07*

rs1800764

ACE

   

5.34E-05

 

2.61E-33*

8.82E-23*

1.09E-40*

1.94E-46*

1.05E-35*

2.63E-43*

7.78E-46*

4.25E-05

  

1.34E-05*

6.39E-06*

4.04E-05

0.000366

0.000415

8.38E-08*

 

3.48E-05*

   

rs4291

ACE

3.00E-30*

1.28E-35*

5.55E-31*

2.57E-26*

4.86E-35*

1.33E-28*

1.67E-29*

2.72E-30*

8.3E-26*

4.86E-35*

6.79E-26*

3.69E-35*

3.1E-29*

1.28E-34*

4.75E-42*

9.11E-29*

2.72E-30*

1.42E-24*

1.18E-31*

6.37E-28*

5.39E-31*

3.96E-29*

8.23E-28*

2.65E-35*

6.22E-30*

1.00E-28*

rs4267385

ACE

     

1.22E-24*

2.4E-15*

3.40E-26*

4.89E-32*

2.33E-33*

3.63E-30*

4.04E-30*

5.61E-06*

  

3.09E-09*

2.69E-10*

1.64E-09*

1.40E-11*

1.79E-12*

7.04E-21*

   

0.000955

 

rs2108622

CYP4F2

       

4.34E-05

   

0.000162

       

2.04E-06*

2.69E-05*

1.82E-08*

1.99E-10*

2.68E-08*

1.38E-07*

1.96E-09*

rs3093105

CYP4F2

1.6E-55*

3.54E-51*

3.51E-54*

1.79E-58*

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2.84E-35*

1.95E-31*

3.3E-41*

1.17E-38*

6.16E-47*

2.88E-42*

  1. Bold indicates*p < 0.05/(52×26) indicates statistical significance