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Table 2 Haplotype distribution of P. infestans for Avr3a, Ras, β-tubuli n and Cox1.

From: Genetic diversity of Phytophthora infestans in the Northern Andean region

       Avr3a              Ras               β-tubulin        Cox 1
Position      1 2 2 2 2 2 2 2 3 4      1 1 1 2 3 3 4 4 4 5 6       1 3 4 4 5 5 7 8 8 8     4 4 6
    4 5 8 0 0 2 3 4 6 8 0 1    6 9 0 1 6 0 1 4 6 7 9 8 3     3 6 3 5 2 7 2 4 7 0 0 1    1 2 4 2
    3 5 3 0 2 0 8 2 4 4 9 5    3 8 5 2 2 3 2 8 2 1 7 7 5    6 0 3 2 5 0 4 8 9 4 1 2 5    1 5 6 0
Site             1 1 1             1 1 1 1             1 1 1 1       
Number    1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2    1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2 3    1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2 3    1 2 3 4
Consensus    A T A A C A A G G A T C    C G A A A G G G G T G T T    C C C A C T G C T T C A T    G A G C
Site Type    v v v v t t t t v t v v    t v v t t t v t v t t t v    t t t t t t t t v t t v v    v t v t
Character Type    _ i _ _ _ _ i _ _ _ i i    i - i i i i i i i i i i i    i i i i i i i i i i - - i    - - - -
  H1 (80) . A . . . . G . . . G A H1 (19) T T C G . A . . . . A C A H1 (68) . . . . . . . T . C . . . H2 (1) C . . .
  H2 (1) T A . . . . G . . . G A H2 (178) . . . . . . . . . . . . . H2 (1) T T T G T . . . G . . . . H1 (94) . . . T
  H3 (2) . . . . . . . . . . . . H3 (2) . . . . . . T A . C . . . H3 (1) T T . . . . . . . C . . G H5 (43) . . . .
  H4 (1) . . . . . . . . . . . A H4 (14) . . . . . . . A . . . . . H4 (1) T T T G T C A . G . . . G H4 (1) . . C .
  H5 (2) . . T C . . . . . . . . H5 (1) . . . . . . . A T C . . . H5 (1) . . . G . C A . . . . . . H3 (3) . G . .
  H6 (2) . . . . T G . A T G . . H6 (20) . . . . . . . A . C . . . H6 (1) . . . . T . . . . . . . .       
                H7 (1) . . . . . . . . . . . C . H7 (11) . . . . . . . . . . . . .       
                H8 (1) T . C G . A . . . . A C A H8 (3) . . . . . . . . . C . . .       
                H9 (1) . . . . G . . . . . . . . H9 (11) . . . . . . . T . . . . .       
                H10 (1) . . . . G . . A . C . . . H10 (3) . . . . . . . T . C T C .       
                H11 (1) . . . . G . . A T . . . . H11 (2) . . . . . . . T . C . . G       
                H12 (2) . . . . . . T . . . . . .                      
                H13 (10) . . . . . . . . . . A C A                      
  1. t: transitions; v: transversions; i: informative sites; -: uninformative sites; H: Haplotype.