Skip to main content

Table 6 D3 evolutionary distances among RNA rings, using frequencies of substitutions as observed in pseudogenes [61]

From: The primordial tRNA acceptor stem code from theoretical minimal RNA ring clusters

D3

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

24

25

1

3.21

9.73

15.91

14.40

15.90

14.21

15.22

15.79

13.72

16.60

13.48

11.97

15.12

15.80

14.11

11.95

12.75

15.87

16.79

12.86

11.19

12.08

14.32

15.95

15.07

2

9.73

3.21

15.11

17.68

15.09

14.63

15.98

16.00

13.73

17.60

12.56

11.89

15.87

16.14

15.90

11.75

13.28

17.66

15.79

14.31

9.38

9.38

15.16

17.60

15.26

3

15.96

15.22

3.21

13.47

4.73

13.49

7.81

7.31

14.19

14.89

15.11

11.99

6.26

14.11

14.98

15.92

17.45

15.67

11.98

19.14

11.99

14.49

14.61

15.42

8.83

4

14.41

17.70

13.54

3.21

12.02

12.80

11.97

12.74

13.77

13.13

15.96

15.93

11.24

15.76

15.69

16.77

16.02

14.66

12.72

15.21

16.73

17.76

15.16

12.02

11.11

5

15.94

15.20

4.73

11.95

3.21

12.76

7.81

7.31

14.19

14.89

15.11

12.72

4.74

14.88

14.21

15.89

17.42

15.67

13.50

19.12

12.72

14.49

14.61

15.42

10.35

6

14.40

14.57

13.38

12.79

12.73

3.21

13.51

12.75

13.64

16.37

15.02

15.11

12.71

14.68

14.98

14.27

13.41

14.84

13.38

15.22

15.91

16.06

13.53

13.59

12.52

7

15.11

15.99

7.81

11.89

7.81

13.64

3.21

8.67

12.78

15.64

15.89

14.29

6.28

14.19

14.97

16.69

17.47

16.41

12.68

17.61

14.29

16.01

15.36

14.59

12.77

8

15.83

16.03

7.23

12.75

7.23

12.77

8.58

3.21

15.14

14.90

16.00

13.70

7.96

14.84

15.00

16.78

17.58

15.68

12.65

17.61

13.70

15.98

12.94

13.68

12.21

9

13.72

13.74

14.29

13.63

14.29

13.68

12.87

15.15

3.21

16.85

17.72

15.92

14.29

15.15

18.45

17.70

17.71

16.85

15.19

16.02

15.13

14.41

17.94

17.81

12.84

10

16.68

17.67

15.00

13.14

15.00

16.40

15.73

15.07

16.87

3.13

13.55

15.78

15.73

9.56

11.75

13.60

14.25

6.19

15.68

15.02

15.92

17.77

14.27

16.52

12.54

11

13.52

12.65

15.03

16.02

15.03

15.12

15.93

15.93

17.74

13.57

3.13

14.19

14.31

12.89

8.78

6.19

9.24

14.37

16.77

11.08

14.98

15.83

10.27

13.48

15.97

12

11.89

11.97

11.97

15.75

12.62

15.13

14.26

13.65

16.02

15.73

14.11

3.21

14.15

17.56

13.40

14.11

12.59

15.81

17.48

14.25

6.64

9.74

13.55

13.74

11.24

13

15.17

15.97

6.26

11.18

4.74

12.75

6.28

8.06

14.19

15.64

14.37

14.25

3.21

14.10

14.95

15.15

16.68

16.41

12.73

17.59

14.25

16.01

14.61

15.42

11.88

14

15.93

16.11

14.23

15.79

15.09

14.69

14.22

14.98

15.10

9.56

12.94

17.53

14.28

3.13

14.29

14.52

16.70

12.62

14.08

15.78

17.52

16.76

12.07

14.27

13.38

15

14.19

15.83

14.99

15.78

14.13

15.01

14.96

14.97

18.45

11.78

8.76

13.57

14.86

14.23

3.13

11.82

13.34

10.25

16.62

14.25

12.65

16.82

11.91

14.36

15.91

16

11.99

11.87

15.82

16.80

15.80

14.36

16.71

16.70

17.72

13.59

6.19

14.19

15.08

14.44

11.84

3.13

6.18

12.86

16.77

9.55

14.20

15.04

11.81

15.03

16.75

17

12.78

13.39

17.35

16.04

17.33

13.59

17.48

17.48

17.75

14.31

9.24

12.66

16.61

16.70

13.36

6.18

3.13

13.59

16.00

6.50

12.68

14.29

14.86

13.52

17.51

18

15.93

17.69

15.77

14.67

15.77

14.87

16.49

15.84

16.87

6.19

14.33

15.82

16.49

12.62

10.23

12.85

13.50

3.13

14.92

15.02

15.17

17.80

15.05

17.30

14.07

19

16.77

15.75

11.98

12.81

13.50

13.49

12.61

12.68

15.10

15.65

16.93

17.44

12.72

14.16

16.64

16.93

16.07

14.90

3.13

16.07

15.73

16.49

17.63

16.91

12.73

20

12.78

14.24

19.08

15.26

19.07

15.24

17.55

17.55

16.05

15.21

11.08

14.33

17.54

15.85

14.30

9.55

6.50

15.21

16.00

3.13

14.34

15.02

15.00

13.52

18.40

21

11.09

9.38

11.97

16.62

12.62

16.00

14.26

13.65

15.22

15.78

14.98

6.64

14.15

17.49

12.56

14.17

12.65

15.05

15.77

14.31

3.21

8.83

15.27

15.45

12.11

22

11.91

9.38

14.47

17.83

14.47

16.07

16.00

15.90

14.35

17.76

15.90

9.75

16.00

16.70

16.87

15.09

14.35

17.84

16.56

15.10

8.82

3.21

16.82

15.41

15.27

23

14.35

15.24

14.61

15.08

14.61

13.54

15.27

13.01

17.94

14.08

10.23

13.63

14.61

11.97

11.81

11.79

14.84

14.89

17.49

14.89

15.35

16.82

3.21

7.81

13.66

24

15.89

17.67

15.41

12.01

15.41

13.69

14.51

13.67

17.89

16.39

13.34

13.80

15.41

14.25

14.16

14.92

13.51

17.20

16.88

13.51

15.52

15.41

7.81

3.21

16.08

25

15.18

15.29

8.89

10.95

10.41

12.60

12.75

12.27

12.90

12.51

15.95

11.24

11.94

13.43

15.79

16.76

17.43

14.04

12.64

18.20

12.03

15.28

13.74

16.01

3.21