Table 2 Frequencies of sire and dam gametes for all possible combinations of alleles at three SNPs (with alleles T/t M/m and K/k) to produce the 27 genotypes
From: Extent of third-order linkage disequilibrium in a composite line of Iberian pigs
Sire | TMK | TmK | tMK | tmK | TMk | Tmk | tMk | tmk | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Dam | Freq | f TMK | f TmK | f tMK | f tmK | f TMk | f Tmk | f tMk | f tmk |
TMK | f TMK | TTMMKK fTMK fTMK | TTMmKK f TMK f TmK | TtMMKK f TMK f tMK | TtMmKK fTMKftmK | TTMMKk fTMKfTMk | TTMmKk fTMKfTmk | TtMMKk fTMK ftMk | TtMmKk fTMKftmk |
TmK | f TmK | TTMmKK fTmK fTMK | TTmmKK f TmK f TmK | TtMmKK fTmKftMK | TtmmKK fTmKftmK | TTMmKk fTmKfTMk | TTmmKk fTmKfTmk | TtMmKk fTmKftMk | TtmmKk fTmKftmk |
tMK | f tMK | TtMMKK ftMK fTMK | TtMmKK ftMKfTmK | ttMMKK ftMK ftMK | ttMmKK ftMKftmK | TtMMKk ftMKfTMk | TtMmKk ftMKfTmk | ttMMKk ftMKftMk | ttMmKk f tMK f tmk |
tmK | f tmK | TtMmKK ftmK fTMK | TtmmKK ftmKfTmK | ttMmKK ftmKftMK | ttmmKK ftmKftmK | TtMmKk ftmKfTMk | TtmmKk ftmKfTmk | ttMmKk ftmKftMk | ttmmKk ftmKftmk |
TMk | f TMk | TTMMKk fTMk fTMK | TTMmKk fTMkfTmK | TtMMKk fTMkftMK | TtMmKk fTMkftmK | TTMMkk fTMkfTMk | TTMmkk fTMkfTmk | TtMMkk fTMkftMk | TtMmkk fTMkftmk |
Tmk | f Tmk | TTMmKk fTmk fTMK | TTmmkK fTmkfTmK | TtMmKk fTmkftMK | TtmmKk fTmkftmK | TTMmkk fTmkfTMk | TTmmkk fTmk fTmk | TtMmkk fTmkftMk | Ttmmkk fTmkftmk |
tMk | f tMk | TtMMKk ftMk fTMK | TtMmKk ftMkfTmK | ttMMKk ftMkftMK | ttMmKk ftMkftmK | TtMMkk ftMkfTMk | TtMmkk ftMkfTmk | ttMMkk ftMkftMk | ttMmkk f tMk f tmk |
tmk | f tmk | TtMmKk ftmk fTMK | TtmmKk ftmkfTmK | ttMmKk ftmkftMK | ttmmKk ftmkftmK | TtMmkk ftmkfTMk | Ttmmkk ftmkfTmk | ttMmkk ftmkftMk | ttmmkk f tmk f tmk |