From: Molecular characterization of MHC class IIB genes of sympatric Neotropical cichlids
Samples | AM05 | AM06 | AH65 | AL11 | AL64 | AQ72 | 27D3 | 25D8 | 27G4 | 25A2 | 25D1 | 25B2 | 27E7 | Total Sequences | ||||||
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Template Allele | gDNA | gDNA | gDNA | gDNA | gDNA | gDNA | gDNA | cDNA | gDNA | cDNA | cDNA | gDNA | cDNA | gDNA | cDNA | gDNA | cDNA | gDNA | cDNA | |
Amci-DXB*000101 | 12 | 13 | 69 | 3 | 21 | 46 | 164 | |||||||||||||
Amci-DXB*000102 | 71 | 10 | 49 | 13 | 77 | 4 | 224 | |||||||||||||
Amci-DXB*000103 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*000104 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*000105 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*000106 | 1 | 2 | 3 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*000107 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*000108 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0002 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0003 | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*0004 | 1 | 1 | 1 | 13 | 16 | |||||||||||||||
Amci-DXB*0005 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*0006 | 2 | 1 | 2 | 5 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*0007 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0008 | 2 | 1 | 1 | 4 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*0009 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0010 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0011 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0012 | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*0013 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0101 | 2 | 2 | 3 | 1 | 2 | 10 | ||||||||||||||
Amci-DXB*0102 | 5 | 2 | 2 | 1 | 9 | 19 | ||||||||||||||
Amci-DXB*0201 | 39 | 1 | 4 | 44 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*0202 | 17 | 14 | 26 | 1 | 58 | |||||||||||||||
Amci-DXB*0203 | 6 | 6 | 12 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*03 | 26 | 1 | 27 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*040101 | 9 | 1 | 4 | 2 | 13 | 7 | 4 | 9 | 10 | 2 | 61 | |||||||||
Amci-DXB*040102 | 5 | 1 | 5 | 3 | 1 | 17 | 3 | 8 | 43 | |||||||||||
Amci-DXB*040103 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0402 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*040301 | 3 | 2 | 1 | 1 | 25 | 3 | 7 | 42 | ||||||||||||
Amci-DXB*040302 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*040303 | 2 | 16 | 13 | 31 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*040304 | 3 | 8 | 18 | 29 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*040305 | 4 | 4 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*0404 | 2 | 1 | 3 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0405 | 3 | 26 | 1 | 16 | 20 | 66 | ||||||||||||||
Amci-DXB*0406 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*05 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*060101 | 1 | 43 | 1 | 31 | 2 | 42 | 16 | 136 | ||||||||||||
Amci-DXB*060102 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0602 | 1 | 6 | 7 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0603 | 5 | 3 | 8 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*0604 | 1 | 1 | 16 | 18 | ||||||||||||||||
Amci-DXB*07 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*08 | 1 | 40 | 41 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*09 | 50 | 9 | 59 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*1001 | 1 | 25 | 26 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*1002 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*110101 | 31 | 42 | 73 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*110102 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*1102 | 8 | 8 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*12 | 1 | 19 | 20 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*13 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*14 | 38 | 38 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*15 | 16 | 16 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*16 | 4 | 34 | 38 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*17 | 4 | 18 | 22 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*18 | 17 | 44 | 23 | 50 | 134 | |||||||||||||||
Amci-DXB*19 | 9 | 9 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*20 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*21 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*2201 | 2 | 23 | 25 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*2202 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*23 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*2401 | 13 | 13 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*25 | 1 | 3 | 4 | |||||||||||||||||
Amci-DXB*26 | 6 | 6 | ||||||||||||||||||
Amci-DXB*27 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||
Total sequences | 118 | 29 | 144 | 20 | 30 | 154 | 207 | 139 | 12 | 103 | 18 | 80 | 91 | 2 | 159 | 69 | 137 | 2 | 109 | 1623 |
Total Alleles | 17 | 8 | 18 | 10 | 9 | 20 | 25 | 9 | 2 | 14 | 14 | 11 | 8 | 69 |