Skip to main content

Table 3 Characterization of the 101 polymorphic sainfoin markers

From: Characterization of novel SSR markers in diverse sainfoin (Onobrychis viciifolia) germplasm

Marker PIC Av PIC Min PIC Max NoA NoA Priv MinAF MaxAF Size
OVK002 0.22 0.06 0.47 9 3 0.03 0.63 154–175
OVK003 0.23 0.06 0.47 11 2 0.03 0.38 92–124
OVK017 0.22 0.06 0.50 19 5 0.03 0.47 148–184
OVK027 0.28 0.06 0.50 9 2 0.03 0.59 120–140
OVK034 0.27 0.06 0.49 12 1 0.03 0.56 138–154
OVK036 0.35 0.17 0.50 7 0 0.09 0.69 133–154
OVK038 0.19 0.06 0.40 14 4 0.03 0.28 155–186
OVK042 0.25 0.00 0.50 2 0 0.50 1.00 183–186
OVK045 0.29 0.12 0.43 6 0 0.09 0.94 138–148
OVK046 0.31 0.06 0.49 12 1 0.03 0.56 138–157
OVK054 0.29 0.12 0.49 15 0 0.06 0.44 274–290
OVK055 0.20 0.06 0.38 8 2 0.03 0.84 135–159
OVK063 0.24 0.06 0.50 13 2 0.03 0.72 179–200
OVK068 0.25 0.06 0.43 9 3 0.03 0.31 186–213
OVK072 0.32 0.12 0.50 4 0 0.06 0.81 193–198
OVK073 0.29 0.06 0.50 11 1 0.03 0.53 186–210
OVK077 0.23 0.06 0.45 9 2 0.03 0.78 233–264
OVK089 0.27 0.06 0.49 9 2 0.03 0.44 279–299
OVK093 0.23 0.06 0.50 14 6 0.03 0.56 234–271
OVK094 0.24 0.06 0.48 14 4 0.03 0.66 208–244
OVK096 0.21 0.06 0.48 20 6 0.03 0.41 215–294
OVK097 0.22 0.06 0.38 3 0 0.13 0.97 240–248
OVK099 0.25 0.06 0.49 13 2 0.03 0.75 232–270
OVK101 0.36 0.06 0.50 7 1 0.03 0.72 339–352
OVK102 0.23 0.06 0.34 4 1 0.03 0.22 239–251
OVK107 0.29 0.06 0.45 15 1 0.03 0.72 206–234
OVK111 0.26 0.06 0.48 7 2 0.03 0.75 213–232
OVK119 0.30 0.06 0.47 10 1 0.03 0.72 216–252
OVK122 0.24 0.06 0.45 8 1 0.03 0.66 330–341
OVK123 0.26 0.06 0.50 10 3 0.03 0.75 208–237
OVK124 0.26 0.06 0.49 15 1 0.03 0.44 218–267
OVK125 0.29 0.06 0.50 9 1 0.03 0.72 197–222
OVK126 0.25 0.06 0.49 15 3 0.03 0.56 198–233
OVK127 0.28 0.06 0.49 6 1 0.03 0.44 204–222
OVK131 0.17 0.06 0.48 15 3 0.03 0.59 183–228
OVK133 0.25 0.06 0.50 13 3 0.03 0.63 205–239
OVK138 0.21 0.06 0.49 13 6 0.03 0.56 232–267
OVK141 0.14 0.06 0.47 15 7 0.03 0.38 242–269
OVK142 0.25 0.06 0.50 12 3 0.03 0.47 256–285
OVK155 0.24 0.06 0.49 14 3 0.03 0.56 234–282
OVK158 0.19 0.06 0.40 24 6 0.03 0.28 273–375
OVK159 0.23 0.06 0.50 14 4 0.03 0.81 268–290
OVK161 0.25 0.06 0.40 12 1 0.03 0.28 220–276
OVK165 0.19 0.06 0.50 20 6 0.03 0.50 273–311
OVK168 0.24 0.06 0.50 11 3 0.03 0.81 258–284
OVK172 0.16 0.00 0.30 5 0 0.06 1.00 268–279
OVK173 0.23 0.06 0.48 18 5 0.03 0.59 268–316
OVK174 0.23 0.06 0.48 5 2 0.03 0.75 245–266
OVK175 0.19 0.06 0.38 10 2 0.03 0.88 252–267
OVK177 0.27 0.06 0.49 7 2 0.03 0.59 267–286
OVK181 0.19 0.06 0.38 19 4 0.03 0.25 343–381
OVK183 0.24 0.06 0.49 17 1 0.03 0.44 266–289
OVK196 0.21 0.06 0.50 8 2 0.03 0.53 297–314
OVM003 0.31 0.12 0.47 10 0 0.06 0.69 299–321
OVM004 0.21 0.06 0.45 18 6 0.03 0.34 380–426
OVM025 0.33 0.17 0.49 7 0 0.09 0.84 306–324
OVM031 0.26 0.00 0.50 13 1 0.03 1.00 292–353
OVM033 0.29 0.06 0.50 8 1 0.03 0.69 308–330
OVM034 0.22 0.06 0.50 17 5 0.03 0.53 307–355
OVM035 0.22 0.06 0.50 17 5 0.03 0.53 301–350
OVM038 0.19 0.06 0.43 14 4 0.03 0.31 311–351
OVM043 0.30 0.06 0.49 10 2 0.03 0.66 173–203
OVM048 0.29 0.12 0.43 6 0 0.06 0.72 174–186
OVM049 0.31 0.06 0.50 9 1 0.03 0.50 162–198
OVM050 0.20 0.06 0.49 13 6 0.03 0.72 168–198
OVM053 0.32 0.06 0.50 11 1 0.03 0.50 134–182
OVM057 0.35 0.17 0.49 5 0 0.09 0.66 165–180
OVM058 0.23 0.06 0.49 15 3 0.03 0.44 135–178
OVM059 0.24 0.06 0.48 7 2 0.03 0.59 156–174
OVM060 0.23 0.06 0.50 21 4 0.03 0.50 172–219
OVM061 0.19 0.06 0.50 10 4 0.03 0.84 143–175
OVM062 0.30 0.06 0.49 12 2 0.03 0.59 151–170
OVM064 0.16 0.06 0.47 16 8 0.03 0.38 380–444
OVM065 0.25 0.06 0.49 14 4 0.03 0.69 360–391
OVM067 0.33 0.17 0.49 6 0 0.09 0.66 366–380
OVM068 0.26 0.12 0.43 8 0 0.06 0.88 343–368
OVM069 0.26 0.06 0.48 13 2 0.03 0.59 454–479
OVM072 0.28 0.00 0.50 7 1 0.03 1.00 365–387
OVM073 0.20 0.06 0.45 21 5 0.03 0.34 446–511
OVM076 0.22 0.06 0.48 17 3 0.03 0.41 347–376
OVM081 0.18 0.06 0.40 17 5 0.03 0.28 353–396
OVM083 0.30 0.06 0.50 11 2 0.03 0.63 365–384
OVM086 0.32 0.06 0.50 10 1 0.03 0.63 371–391
OVM090 0.30 0.06 0.49 8 2 0.03 0.84 158–180
OVM091 0.34 0.06 0.50 8 1 0.03 0.47 184–217
OVM092 0.23 0.06 0.43 7 2 0.03 0.81 163–185
OVM094 0.33 0.12 0.50 7 0 0.06 0.81 190–207
OVM099 0.18 0.06 0.50 11 5 0.03 0.50 165–198
OVM100 0.24 0.00 0.48 5 0 0.09 1.00 163–179
OVM110 0.21 0.06 0.49 18 5 0.03 0.44 163–185
OVM116 0.28 0.06 0.49 15 2 0.03 0.56 138–204
OVM120 0.34 0.06 0.50 6 1 0.03 0.88 169–187
OVM122 0.31 0.06 0.50 4 1 0.03 0.91 164–180
OVM125 0.26 0.06 0.50 10 3 0.03 0.47 161–180
OVM126 0.22 0.06 0.50 18 4 0.03 0.53 191–229
OVM128 0.26 0.06 0.47 9 1 0.03 0.81 173–190
OVM129 0.25 0.06 0.49 14 4 0.03 0.56 146–173
OVM130 0.20 0.06 0.47 20 7 0.03 0.38 152–187
OVM131 0.34 0.06 0.50 8 2 0.03 0.56 159–198
OVM132 0.30 0.06 0.47 8 2 0.03 0.78 157–176
OVM133 0.20 0.06 0.47 14 3 0.03 0.63 177–212
  1. PICAv, PICMin and PICMax give the average, minimum and maximum allele-wise polymorphism information content values, NoATot the total number of alleles, NoAPriv the number of private alleles, MinAF the minimum allele frequency and MaxAF the maximum allele frequency value