Table 3 SNP genetic diversity within and between supposed ancestral varietal groups

2P737170

0.11

0.23

0.52

0.02

0.03

0.33

0.01

0.01

−0.04

0.15

0.08

−1.00

0.08

0.07

−0.22

0.78

SD

0.07

0.15

0.25

0.02

0.11

0.00

0.03

0.02

0.00

0.36

0.18

0.00

0.04

0.15

0.08

0.33

CI

0.03

0.07

0.11

0.02

0.05

-

0.01

0.01

-

0.16

0.08

-

0.02

0.07

0.08

0.14

2P3068140

0.18

0.33

0.46

0.00

0.00

-

0.07

0.10

−0.01

0.00

0.00

-

0.02

0.02

−0.18

0.72

SD

0.08

0.17

0.22

0.00

0.00

-

0.12

0.10

0.13

0.00

0.00

-

0.04

0.07

-

0.40

CI

0.05

0.09

0.12

-

-

-

0.06

0.05

0.07

-

-

-

0.02

0.04

-

0.22

2P4517048

0.09

0.19

0.55

0.01

0.01

−0.09

0.10

0.08

−0.17

0.00

0.00

-

0.06

0.05

−0.14

0.48

SD

0.07

0.19

0.33

0.03

0.04

-

0.07

0.18

0.22

0.00

0.00

-

0.08

0.09

0.04

0.47

CI

0.04

0.11

0.19

0.02

0.02

-

0.04

0.10

0.25

-

-

-

0.05

0.05

0.04

0.27

2P8108334

0.12

0.20

0.42

0.01

0.04

0.80

0.04

0.06

0.38

0.21

0.10

−1.00

0.14

0.09

−0.52

0.52

SD

0.09

0.18

0.36

0.01

0.10

0.49

0.05

0.14

0.28

0.41

0.20

0.00

0.06

0.17

0.33

0.36

CI

0.03

0.06

0.11

0.01

0.03

0.39

0.03

0.04

0.18

0.13

0.06

-

0.04

0.05

0.20

0.11

2P11442721

0.15

0.18

0.18

0.02

0.02

−0.09

0.23

0.20

−0.19

0.00

0.00

-

0.06

0.06

0.04

0.32

SD

0.11

0.13

0.26

0.05

0.05

0.00

0.09

0.20

0.16

0.00

0.00

-

0.06

0.12

0.32

0.35

CI

0.05

0.05

0.11

0.04

0.02

0.00

0.05

0.08

0.09

-

-

-

0.04

0.05

0.28

0.15

2P13928427

0.11

0.17

0.38

0.04

0.05

0.17

0.06

0.05

−0.11

0.10

0.05

−1.00

0.01

0.01

−0.05

0.40

SD

0.08

0.16

0.23

0.04

0.15

0.00

0.11

0.08

0.05

0.30

0.15

0.00

0.03

0.03

0.00

0.38

CI

0.04

0.07

0.10

0.04

0.06

-

0.06

0.04

0.04

0.13

0.07

-

0.02

0.01

-

0.16

2P21022460

0.12

0.19

0.34

0.00

0.04

1.00

0.05

0.06

0.11

0.18

0.09

−1.00

0.10

0.07

−0.50

0.49

SD

0.08

0.13

0.28

0.00

0.13

-

0.07

0.13

0.11

0.39

0.20

0.00

0.03

0.16

0.35

0.41

CI

0.05

0.08

0.16

-

0.08

-

0.03

0.08

0.11

0.23

0.12

-

0.02

0.09

0.48

0.24

2P25198627

0.17

0.21

0.20

0.08

0.10

0.16

0.10

0.13

0.23

0.17

0.08

−1.00

0.20

0.15

−0.38

0.34

SD

0.14

0.16

0.20

0.08

0.18

0.61

0.14

0.18

0.22

0.37

0.19

0.00

0.10

0.22

0.05

0.33

CI

0.08

0.09

0.12

0.06

0.10

0.69

0.07

0.10

0.15

0.21

0.11

-

0.06

0.12

0.05

0.19

2P26819388

0.09

0.16

0.46

0.07

0.05

−0.33

0.08

0.13

0.45

0.32

0.17

−1.00

0.02

0.02

−0.33

0.25

SD

0.10

0.17

0.30

0.06

0.13

0.00

0.10

0.19

0.36

0.47

0.24

0.00

0.02

0.08

-

0.18

CI

0.04

0.07

0.12

0.05

0.05

-

0.07

0.08

0.21

0.19

0.10

-

0.01

0.03

-

0.07

2P29538734

0.17

0.26

0.34

0.00

0.03

1.00

0.19

0.16

−0.18

0.06

0.03

−1.00

0.05

0.05

−0.07

0.53

SD

0.11

0.16

0.28

0.00

0.09

0.00

0.16

0.17

0.09

0.23

0.11

0.00

0.06

0.10

0.37

0.39

CI

0.04

0.05

0.09

-

0.03

-

0.08

0.05

0.04

0.08

0.04

-

0.04

0.03

0.23

0.13

2P30446231

0.12

0.20

0.37

0.02

0.04

0.56

0.10

0.11

0.07

0.08

0.04

−1.00

0.10

0.16

0.39

0.47

SD

0.09

0.14

0.28

0.04

0.12

0.00

0.12

0.17

0.11

0.27

0.14

0.00

0.07

0.20

0.44

0.37

CI

0.03

0.05

0.11

0.03

0.05

-

0.06

0.07

0.07

0.10

0.05

-

0.05

0.08

0.26

0.14

2P32507721

0.14

0.21

0.31

0.00

0.00

-

0.29

0.31

0.06

0.18

0.08

−1.00

0.07

0.04

−0.60

0.43

SD

0.10

0.14

0.18

0.00

0.00

-

0.25

0.24

0.05

0.39

0.19

0

0.04

0.14

-

0.32

CI

0.06

0.08

0.10

-

-

-

0.13

0.14

0.03

0.23

0.11

-

0.02

0.08

-

0.18

2P33506778

0.18

0.29

0.37

0.00

0.00

-

0.18

0.17

−0.07

0.00

0.00

-

0.05

0.06

0.20

0.81

SD

0.13

0.17

0.11

0.00

0.00

-

0.17

0.21

0.02

0.00

0.00

-

0.08

0.15

-

0.20

CI

0.10

0.13

0.09

-

-

-

0.09

0.17

0.03

-

-

-

0.05

0.12

-

0.16

2P33532337

0.19

0.32

0.39

0.00

0.07

1.00

0.23

0.24

−0.14

0.00

0.00

-

0.04

0.09

0.52

0.65

SD

0.11

0.15

0.15

0.00

0.08

0.00

0.26

0.17

0.20

0.00

0.00

-

0.09

0.19

0.00

0.31

CI

0.07

0.10

0.10

-

0.05

-

0.14

0.11

0.15

-

-

-

0.06

0.12

-

0.21

2P35391362

0.22

0.37

0.41

0.01

0.01

−0.09

0.24

0.20

−0.24

0.00

0.00

-

0.02

0.06

−0.15

0.73

SD

0.09

0.13

0.16

0.02

0.04

-

0.24

0.18

0.10

0.00

0.00

-

0.03

0.09

0.09

0.24

CI

0.04

0.06

0.07

0.02

0.02

-

0.13

0.08

0.06

-

-

-

0.02

0.04

0.06

0.11

2P36235952

0.13

0.28

0.55

0.00

0.00

-

0.02

0.04

0.45

0.04

0.02

−1.00

0.08

0.07

−0.28

0.55

SD

0.08

0.21

0.34

0.00

0.00

-

0.04

0.11

0.35

0.20

0.10

0.00

0.02

0.13

0.15

0.47

CI

0.03

0.08

0.14

-

-

-

0.02

0.04

0.26

0.08

0.04

-

0.01

0.05

0.12

0.19

Total

0.14

0.23

0.29

0.02

0.03

0.46

0.12

0.12

−0.02

0.09

0.05

−1.00

0.07

0.07

−0.08

0.51

SD

0.10

0.17

0.28

0.01

0.10

0.53

0.05

0.17

0.24

0.19

0.15

0.00

0.02

0.14

0.37

0.38

CI

0.03

0.02

0.03

0.01

0.01

0.19

0.03

0.02

0.04

0.09

0.02

-

0.01

0.02

0.09

0.04