Skip to main content

Table 1 Average space (bp), Linkage Disequilibrium ( r 2 ) and standard deviation (s.d.) between adjacent single nucleotide polymorphisms (SNPs) on each chromosome (OAR) in the Sicilian sheep breeds

From: Genome wide linkage disequilibrium and genetic structure in Sicilian dairy sheep breeds

 

VDB

COM

PIN

OAR

Average space

r2 ± s.d.

Average space

r2 ± s.d.

Average space

r2 ± s.d.

1

60,381

0.162 ± 0.205

60,211

0.161 ± 0.213

58,874

0.132 ± 0.190

2

56,594

0.182 ± 0.229

57,023

0.189 ± 0.237

55,298

0.148 ± 0.208

3

57,120

0.170 ± 0.217

56,744

0.172 ± 0.224

55,389

0.140 ± 0.198

4

55,435

0.171 ± 0.219

54,484

0.164 ± 0.216

53,770

0.139 ± 0.200

5

57,306

0.150 ± 0.199

57,292

0.154 ± 0.205

55,749

0.127 ± 0.188

6

57,242

0.158 ± 0.204

57,138

0.165 ± 0.216

55,381

0.131 ± 0.188

7

56,080

0.151 ± 0.200

56,256

0.158 ± 0.209

55,645

0.137 ± 0.194

8

54,964

0.164 ± 0.211

54,444

0.155 ± 0.206

54,142

0.133 ± 0.192

9

55,391

0.167 ± 0.218

54,938

0.170 ± 0.222

53,755

0.137 ± 0.196

10

57,388

0.168 ± 0.224

56,578

0.179 ± 0.230

56,003

0.148 ± 0.217

11

68,228

0.155 ± 0.198

66,998

0.155 ± 0.208

65,042

0.118 ± 0.177

12

58,985

0.165 ± 0.210

58,205

0.157 ± 0.207

57,224

0.131 ± 0.190

13

61,411

0.151 ± 0.204

60,698

0.170 ± 0.219

60,245

0.133 ± 0.197

14

67,767

0.133 ± 0.187

67,759

0.134 ± 0.188

67,623

0.114 ± 0.182

15

61,225

0.149 ± 0.202

61,225

0.153 ± 0.209

59,525

0.129 ± 0.189

16

57,537

0.149 ± 0.199

58,498

0.157 ± 0.212

56,483

0.124 ± 0.184

17

65,423

0.155 ± 0.208

64,034

0.152 ± 0.208

62,553

0.125 ± 0.191

18

60,008

0.149 ± 0.200

59,676

0.156 ± 0.205

59,039

0.128 ± 0.191

19

60,499

0.156 ± 0.213

61,012

0.167 ± 0.217

59,829

0.139 ± 0.201

20

57,307

0.150 ± 0.197

57,482

0.138 ± 0.187

56,644

0.117 ± 0.168

21

69,546

0.152 ± 0.206

68,146

0.151 ± 0.205

68,551

0.124 ± 0.175

22

57,485

0.154 ± 0.204

57,852

0.155 ± 0.209

56,128

0.125 ± 0.192

23

69,395

0.156 ± 0.193

68,358

0.140 ± 0.189

67,233

0.107 ± 0.164

24

71,118

0.134 ± 0.184

71,232

0.134 ± 0.187

70,438

0.108 ± 0.168

25

55,503

0.141 ± 0.190

56,750

0.142 ± 0.202

54,932

0.116 ± 0.183

26

61,598

0.143 ± 0.190

62,022

0.137 ± 0.178

59,862

0.116 ± 0.171

mean

60,421

0.155 ± 0.204

60,194

0.156 ± 0.208

59,062

0.128 ± 0.188

  1. Valle del Belice (VDB), Comisana (COM) and Pinzirita (PIN) sheep breeds.