Skip to main content

Table 3 Power for detecting interactions between loci using LODPAL (NY population)

From: Methods for detecting gene × gene interaction in multiplex extended pedigrees

Phenotype SNP covariate Model Marker-region Power (single point) Power (multipoint)
KPD D1 dom D2 0.23 0.20
   rec D2 0.18 0.22
   dom D4 0.19 0.17
   rec D4 0.14 0.11
  D2 dom D1 0.29 0.22
   rec D1 0.25 0.21
   dom D3 0.22 0.19
   rec D3 0.15 0.10
  D3 dom D2 0.26 0.23
   rec D2 0.17 0.15
   dom D4 0.20 0.20
   rec D4 0.12 0.14
  D4 dom D1 0.32 0.26
   rec D1 0.25 0.20
   dom D3 0.23 0.23
   rec D3 0.15 0.13
P1 D1 dom D2 0.14 0.10
   rec D2 0.18 0.14
  D2 dom D1 0.42 0.29
   rec D1 0.32 0.34
P2 D2 dom D3 0.21 0.18
   rec D3 0.13 0.09
  D3 dom D2 0.22 0.14
   rec D2 0.11 0.10
   dom D4 0.16 0.17
   rec D4 0.18 0.13
  D4 dom D3 0.18 0.21
   rec D3 0.16 0.12
P3 D1 dom D4 0.14 0.09
   rec D4 0.08 0.07
  D2 dom D3 0.14 0.08
   rec D3 0.11 0.08
  D3 dom D2 0.09 0.13
   rec D2 0.12 0.09
  D4 dom D1 0.25 0.19
   rec D1 0.17 0.18