Skip to main content

Table 4 QTL conditions for the simulation of multiple-QTLs

From: Effect of advanced intercrossing on genome structure and on the power to detect linked quantitative trait loci in a multi-parent population: a simulation study in rice

Allele frequency

Variance of the additive effects of a QTL

List of additive effect size

4:4

0.03

0.35

0.35

0.35

0.35

0.00

0.00

0.00

0.00

0.04

0.40

0.40

0.40

0.40

0.00

0.00

0.00

0.00

0.05

0.45

0.45

0.45

0.45

0.00

0.00

0.00

0.00

0.06

0.49

0.49

0.49

0.49

0.00

0.00

0.00

0.00

0.07

0.53

0.53

0.53

0.53

0.00

0.00

0.00

0.00

2:6

0.03

0.40

0.40

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.04

0.46

0.46

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.05

0.52

0.52

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.06

0.57

0.57

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.07

0.61

0.61

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

1:7

0.03

0.52

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.04

0.60

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.05

0.68

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.06

0.74

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.07

0.80

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

3:2:3

0.03

0.40

0.40

0.40

0.20

0.20

0.00

0.00

0.00

0.04

0.46

0.46

0.46

0.23

0.23

0.00

0.00

0.00

0.05

0.52

0.52

0.52

0.26

0.26

0.00

0.00

0.00

0.06

0.57

0.57

0.57

0.28

0.28

0.00

0.00

0.00

0.07

0.61

0.61

0.61

0.31

0.31

0.00

0.00

0.00

2:4:2

0.03

0.49

0.49

0.24

0.24

0.24

0.24

0.00

0.00

0.04

0.57

0.57

0.28

0.28

0.28

0.28

0.00

0.00

0.05

0.63

0.63

0.32

0.32

0.32

0.32

0.00

0.00

0.06

0.69

0.69

0.35

0.35

0.35

0.35

0.00

0.00

0.07

0.75

0.75

0.37

0.37

0.37

0.37

0.00

0.00

2:2:2:2

0.03

0.46

0.46

0.31

0.31

0.15

0.15

0.00

0.00

0.04

0.54

0.54

0.36

0.36

0.18

0.18

0.00

0.00

0.05

0.60

0.60

0.40

0.40

0.20

0.20

0.00

0.00

0.06

0.66

0.66

0.44

0.44

0.22

0.22

0.00

0.00

0.07

0.71

0.71

0.47

0.47

0.24

0.24

0.00

0.00

1:1:1:1:1:1:1:1

0.03

0.53

0.45

0.38

0.30

0.23

0.15

0.08

0.00

0.04

0.61

0.52

0.44

0.35

0.26

0.17

0.09

0.00

0.05

0.68

0.59

0.49

0.39

0.29

0.20

0.10

0.00

0.06

0.75

0.64

0.53

0.43

0.32

0.21

0.11

0.00

 

0.07

0.81

0.69

0.58

0.46

0.35

0.23

0.12

0.00