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Table 1 Diversity parameters of the SSRs for the tested peach cultivars

From: Peach genetic resources: diversity, population structure and linkage disequilibrium

Marker Sample size Ao Ae Ho He F PD MAF Gn
UDP96-018 653 12 2.33 0.42 0.55 0.25 0.73 0.63 23
CPPCT027 653 11 2.32 0.46 0.50 0.08 0.68 0.68 22
EPPCU1090 653 7 2.70 0.53 0.59 0.10 0.79 0.59 14
UDP96-005 653 15 4.31 0.63 0.73 0.14 0.88 0.41 41
CPPCT026 653 21 5.01 0.61 0.78 0.23 0.90 0.37 56
BPPCT020 653 10 2.59 0.49 0.65 0.24 0.81 0.43 16
CPPCT029 653 13 2.27 0.45 0.61 0.26 0.77 0.50 34
CPPCT044 653 13 4.30 0.52 0.76 0.31 0.89 0.41 39
CPPCT042 653 15 2.19 0.41 0.64 0.36 0.80 0.50 33
BPPCT001 653 14 3.11 0.51 0.79 0.35 0.90 0.36 47
BPPCT024 653 10 5.52 0.49 0.75 0.35 0.85 0.42 28
UDP96-013 653 14 3.73 0.50 0.76 0.34 0.88 0.31 31
pceGA34 653 9 2.05 0.41 0.55 0.26 0.72 0.51 16
pchgms1 653 6 1.71 0.23 0.31 0.26 0.46 0.81 7
UDP98-025 653 8 2.87 0.47 0.75 0.38 0.88 0.35 21
BPPCT007 653 11 4.34 0.63 0.73 0.15 0.88 0.43 33
BPPCT039 653 7 1.61 0.41 0.39 −0.05 0.57 0.75 11
CPPCT002 653 8 2.37 0.42 0.59 0.28 0.74 0.46 14
UDP96-008 653 8 2.82 0.47 0.61 0.23 0.79 0.52 18
UDP96-003 653 15 2.99 0.61 0.66 0.08 0.80 0.43 40
UDP98-024 653 11 2.56 0.56 0.63 0.12 0.81 0.43 19
PTS1-SSR 429 10 3.95 0.61 0.75 0.18 0.89 0.34 21
CPPCT005 653 15 2.31 0.48 0.61 0.21 0.79 0.54 26
BPPCT015 653 20 2.82 0.55 0.66 0.17 0.81 0.46 43
CPPCT046 653 12 2.69 0.44 0.62 0.29 0.78 0.45 22
CPPCT040 653 12 2.68 0.58 0.63 0.07 0.76 0.51 25
EPPCU1775 429 13 3.68 0.51 0.73 0.30 0.75 0.39 26
UDP97-401 653 11 2.25 0.45 0.52 0.14 0.67 0.58 16
BPPCT017 653 16 3.95 0.58 0.71 0.18 0.86 0.38 44
BPPCT037 653 16 1.92 0.49 0.50 0.02 0.66 0.66 25
BPPCT038 653 13 3.28 0.52 0.69 0.24 0.83 0.48 40
BPPCT014 653 11 1.55 0.28 0.36 0.21 0.50 0.79 16
CPPCT013 653 6 1.64 0.28 0.29 0.05 0.46 0.83 11
CPSCT006 653 10 2.05 0.40 0.42 0.05 0.61 0.74 20
CPPCT015 653 13 1.46 0.16 0.23 0.34 0.34 0.87 30
BPPCT025 653 16 5.54 0.62 0.81 0.24 0.94 0.30 56
pchcms5 653 10 2.41 0.46 0.53 0.13 0.72 0.64 20
UDP96-001 653 13 4.04 0.51 0.68 0.26 0.84 0.50 30
CPPCT022 653 24 3.77 0.59 0.78 0.25 0.92 0.35 58
CPPCT030 653 14 2.28 0.56 0.60 0.07 0.79 0.58 34
CPPCT033 653 9 1.84 0.24 0.56 0.57 0.68 0.58 19
PMS02 653 12 1.23 0.13 0.17 0.23 0.28 0.91 22
pchgms6 653 14 3.17 0.49 0.70 0.30 0.86 0.42 35
BPPCT006 653 15 6.97 0.63 0.85 0.26 0.95 0.26 65
UDP98-409 653 13 2.80 0.49 0.60 0.19 0.77 0.57 24
CPPCT006 653 10 2.25 0.49 0.63 0.23 0.79 0.49 15
PCeGA25 429 8 1.61 0.36 0.38 0.06 0.54 0.76 13
Pchgms3 653 14 2.88 0.48 0.57 0.17 0.74 0.61 29
Mean   12.25 2.93 0.47 0.60 0.22 0.75 0.53 28
  1. Note: Ao number of observed alleles, Ae effective number of alleles, Ho observed heterozygosity, He expected heterozygosity.
  2. MAF frequency of major allele, F Wright’s fixation index, PD power of discrimination, Gn number of genotype at each locus.