Skip to main content

Table 2 Distribution of 14 main haplotype frequencies in the MUC4 gene in corresponding pig populations

From: Nucleotide variability and linkage disequilibrium patterns in the porcine MUC4 gene

 

N

Hap1

Hap2

Hap3

Hap4

Hap5

Hap6

Hap7

Hap8

Hap9

Hap10

Hap11

Hap12

Hap13

Hap14

ALL

278

0.183

0.155

0.115

0.090

0.065

0.043

0.032

0.032

0.029

0.025

0.025

0.025

0.022

0.022

Chinese breeds

182

0.290

0.028

0.017

0.142

0.102

0.000

0.051

0.051

0.011

0.040

0.040

0.040

0.034

0.000

  Bama Xiang

12

0.000

0.167

0.083

0.000

0.083

0.000

0.083

0.000

0.000

0.000

0.417

0.000

0.000

0.000

  Erhualian

46

0.435

0.000

0.000

0.283

0.065

0.000

0.000

0.000

0.000

0.043

0.000

0.065

0.000

0.000

  Hang

18

0.167

0.000

0.000

0.167

0.000

0.000

0.333

0.333

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

  Jiangquhai

22

0.364

0.000

0.000

0.182

0.000

0.000

0.000

0.000

0.091

0.091

0.000

0.045

0.000

0.000

  Jinhua

14

0.071

0.000

0.000

0.000

0.286

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.429

0.000

  Laiwu

10

0.000

0.200

0.200

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.300

0.000

0.000

0.000

0.000

  Rongchang

4

0.000

0.000

0.000

0.000

0.250

0.000

0.000

0.250

0.000

0.000

0.250

0.000

0.000

0.000

  Shaziling

6

0.000

0.000

0.000

0.000

0.167

0.000

0.000

0.167

0.000

0.000

0.167

0.167

0.000

0.000

  Tibet

8

0.375

0.000

0.000

0.000

0.125

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.125

0.000

0.000

  Tongcheng

10

0.400

0.100

0.000

0.100

0.100

0.000

0.200

0.100

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

  Yushan Black

26

0.462

0.000

0.000

0.154

0.231

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.038

0.000

0.000

Western breeds

102

0.000

0.373

0.284

0.000

0.000

0.118

0.000

0.000

0.059

0.000

0.000

0.000

0.000

0.059

  Duroc

14

0.000

0.071

0.071

0.000

0.000

0.071

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.357

  Landrace

38

0.000

0.474

0.289

0.000

0.000

0.211

0.000

0.000

0.026

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

  Large White

50

0.000

0.380

0.340

0.000

0.000

0.060

0.000

0.000

0.100

0.000

0.000

0.000

0.000

0.020

  1. N, Number of haplotypes, the 14 haplotypes were ordered by their frequencies in all tested animals. Red (blue) background represents the haplotypes that are unique to Chinese (Western) breeds.