TY - BOOK PY - 2003 DA - 2003// TI - Fire blight, The Foundation of Phytobacteriology PB - APS Press CY - St Paul, Minn ID - ref1 ER - TY - JOUR AU - Norelli, J. L. AU - Jones, A. L. AU - Aldwinckle, H. S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Fire blight management in the 21st century: using new technologies that enhance host resistance in apple JO - Plant Dis VL - 87 ID - Norelli2003 ER - TY - JOUR AU - Peil, A. AU - Bus, V. G. M. AU - Geider, K. AU - Richter, K. AU - Flachowsky, H. AU - Hanke, M. -. V. PY - 2009 DA - 2009// TI - Improvement of fire blight resistance in apple and pear JO - Int J Plant Breed VL - 3 ID - Peil2009 ER - TY - JOUR AU - Roberts, R. G. AU - Sawyer, A. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - An updated pest risk assessment for spread ofErwinia amylovoraand fire blight via commercial apple fruit JO - Crop Prot VL - 27 ID - Roberts2008 ER - TY - STD TI - USDA-National Institute of Food and Agriculture, Plant Breeding, Genetics, Genomics, Fire Blight Resistant Apples.[http://www.csrees.usda.gov/nea/plants/in_focus/pbgg_if_fire_blight_resistant_apples.html] UR - http://www.csrees.usda.gov/nea/plants/in_focus/pbgg_if_fire_blight_resistant_apples.html ID - ref5 ER - TY - JOUR AU - Loper, J. E. AU - Henkels, M. D. AU - Roberts, R. G. AU - Grove, G. G. AU - Willet, M. J. AU - Smith, T. J. PY - 1991 DA - 1991// TI - Evaluation of streptomycin, oxytetracycline, and copper resistance ofErwinia amylovoraisolated from pear orchards in Washington State JO - Plant Dis VL - 75 ID - Loper1991 ER - TY - JOUR AU - McManus, P. S. AU - Stockwell, V. O. AU - Sundin, G. W. AU - Jones, A. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Antibiotic use in plant agriculture JO - Annu Rev Phytopathol VL - 40 ID - McManus2002 ER - TY - JOUR AU - Sholberg, P. AU - Bedford, K. AU - Haag, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Occurrence and control of streptomycin-resistantErwinia amylovorain British Columbia JO - Can J Plant Pathol VL - 22 ID - Sholberg2000 ER - TY - JOUR AU - Jock, S. AU - Donat, V. AU - López, M. M. AU - Bazzi, C. AU - Geider, K. PY - 2002 DA - 2002// TI - Following spread of fire blight in Western, Central and Southern Europe by molecular differentiation ofErwinia amylovorastrains with PFGE analysis JO - Environ Micro VL - 4 ID - Jock2002 ER - TY - CHAP AU - Bonn, W. G. AU - van der Zwet, T. ED - Vanneste, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Distribution and economic importance of fire blight BT - Fire blight : the disease and its causative agent, Erwinia amylovora PB - CABI CY - Wallingford ID - Bonn2000 ER - TY - JOUR AU - McManus, P. S. AU - Jones, A. L. PY - 1995 DA - 1995// TI - Genetic fingerprinting ofErwinia amylovorastrains isolated from tree-fruit crops andRubusspp JO - Phytopathology VL - 85 ID - McManus1995 ER - TY - JOUR AU - Zang, Y. AU - Geider, K. PY - 1997 DA - 1997// TI - Differentiation ofErwinia amylovorastrains by pulsed-field gel electrophoresis JO - Appl Environ Microbiol VL - 63 ID - Zang1997 ER - TY - JOUR AU - Peil, A. AU - Richter, K. AU - Garcia-Libreros, T. AU - Hanke, V. AU - Flachowsky, H. AU - Celton, J. -. M. AU - Horner, M. AU - Gardiner, S. AU - Bus, V. PY - 2008 DA - 2008// TI - Confirmation of the fire blight QTL ofMalusxrobusta5 on linkage group 3 JO - Acta Hort VL - 793 ID - Peil2008 ER - TY - CHAP AU - Parravicini, G. AU - Gessler, C. AU - Denancé, C. AU - Lasserre-Zuber, P. AU - Vergne, E. AU - Brisset, M. -. N. AU - Patocchi, A. AU - Durel, C. -. E. AU - Broggini, G. A. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Identification of serine/threonine kinase and nucleotide-binding site-leucine-rich repeat (NBS-LRR) genes in the fire blight resistance quantitative trait locus of apple cultivar ‘Evereste’ BT - Mol Plant Pathol ID - Parravicini2011 ER - TY - JOUR AU - Norelli, J. L. AU - Aldwinckle, H. S. AU - Beer, S. V. PY - 1984 DA - 1984// TI - Differential host pathogen interactions among cultivars of apple and strains ofErwinia amylovora JO - Phytopathology VL - 74 ID - Norelli1984 ER - TY - JOUR AU - Norelli, J. L. AU - Aldwinckle, H. S. AU - Beer, S. V. PY - 1986 DA - 1986// TI - Differential susceptibility ofMalusspp. Cultivars Robusta 5, Novole, and Ottawa 523 toErwinia amylovora JO - Plant Dis VL - 70 ID - Norelli1986 ER - TY - JOUR AU - Paulin, J. P. AU - Lachaud, G. AU - Lespinasse, Y. PY - 1993 DA - 1993// TI - Role of the aggressiveness of strains ofErwinia amylovorain the experimental evaluation of susceptibility of apple cultivars to fire blight JO - Acta Hort VL - 338 ID - Paulin1993 ER - TY - JOUR AU - Fazio, G. AU - Aldwinckle, H. S. AU - McQuinn, R. P. AU - Robinson, T. L. PY - 2006 DA - 2006// TI - Differential susceptibility to fire blight in commercial and experimental apple rootstock cultivars JO - Acta Hort VL - 704 ID - Fazio2006 ER - TY - CHAP AU - Gardiner, S. E. AU - Bus, V. G. M. AU - Rusholme, R. L. AU - Chagné, D. AU - Rikkerink, E. H. A. ED - Kole, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Apple BT - Genome Mapping and Molecular Breeding in Plants 4, Fruits and Nuts PB - Springer-Verlag CY - Berlin ID - Gardiner2007 ER - TY - JOUR AU - Khan, M. A. AU - Duffy, B. AU - Gessler, C. AU - Patocchi, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - QTL mapping of fire blight resistance in apple JO - Mol Breed VL - 17 ID - Khan2006 ER - TY - JOUR AU - Khan, M. A. AU - Durel, C. -. E. AU - Duffy, B. AU - Drouet, D. AU - Kellerhals, M. AU - Gessler, C. AU - Patocchi, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Development of molecular markers linked to the 'Fiesta' linkage group 7 major QTL for fire blight resistance and their application for marker-assisted selection JO - Genome VL - 50 ID - Khan2007 ER - TY - JOUR AU - Peil, A. AU - Garcia-Libreros, T. AU - Richter, K. AU - Trognitz, F. C. AU - Trognitz, B. AU - Hanke, M. -. V. AU - Flachowsky, H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Strong evidence for a fire blight resistance gene ofMalus robustalocated on linkage group 3 detected by rapid genome scanning JO - Plant Breed VL - 126 ID - Peil2007 ER - TY - JOUR AU - Calenge, F. AU - Drouet, D. AU - Denancé, C. AU - van de Weg, W. E. AU - Brisset, M. N. AU - Paulin, J. -. P. AU - Durel, C. -. E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Identification of a major QTL together with several minor additive or epistatic QTLs for resistance to fire blight in apple in two related progenies JO - Theor Appl Genet VL - 111 ID - Calenge2005 ER - TY - JOUR AU - Le Roux, P. -. M. F. AU - Khan, M. A. AU - Broggini, B. AU - Duffy, C. AU - Gessler, C. AU - Patocchi, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Mapping of quantitative trait loci for fire blight resistance in the apple cultivars ‘Florina’ and ‘Nova Easygro’ JO - Genome VL - 53 ID - Le Roux2010 ER - TY - JOUR AU - Durel, C. E. AU - Denancé, C. AU - Brisset, M. N. PY - 2009 DA - 2009// TI - Two distinct major QTL for resistance to fire blight co-localize on linkage group 12 in apple genotypes ‘Evereste’ andMalus floribundaclone 821 JO - Genome VL - 52 ID - Durel2009 ER - TY - JOUR AU - Dunemann, F. AU - Peil, A. AU - Urbanietz, A. AU - Garcia-Liberos, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mapping of the apple powdery mildew resistance gene Pl1 and its genetic association with a NBS-LRR candidate resistance gene JO - Plant Breed VL - 126 ID - Dunemann2007 ER - TY - JOUR AU - Durel, C. E. AU - van de Weg, W. E. AU - Vennisse, J. S. AU - Parisi, L. PY - 2000 DA - 2000// TI - Localisation of a major gene for apple scab resistance on the European genetic map of the Prima x Fiesta cross JO - IOBC wprs Bull VL - 23 ID - Durel2000 ER - TY - JOUR AU - Cummins, J. N. AU - Aldwinckle, H. S. PY - 1983 DA - 1983// TI - Breeding apple rootstocks JO - Plant Breed Rev VL - 1 ID - Cummins1983 ER - TY - JOUR AU - Fahrentrapp, J. AU - Broggini, G. A. L. AU - Gessler, C. AU - Peil, A. AU - Kellerhals, M. AU - Malnoy, M. AU - Richter, K. PY - 2011 DA - 2011// TI - Fine mapping of fire blight resistance locus inMalusxrobusta5 on linkage group 3 JO - Acta Hort VL - 896 ID - Fahrentrapp2011 ER - TY - JOUR AU - Fazio, G. AU - Wan, Y. AU - Russo, N. L. AU - Aldwinckle, H. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Investigation on the inheritance of strain specific resistance toErwinia amylovorain an apple rootstock segregating population JO - Acta Hort VL - 793 ID - Fazio2008 ER - TY - CHAP AU - Arùs, P. AU - Gardiner, S. ED - Varshney, R. ED - Tuberosa, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genomics for improvement of Rosaceae temperate tree fruit BT - Genomics-Assisted Crop Improvement PB - Springer CY - New York ID - Arùs2008 ER - TY - JOUR AU - Espley, R. V. AU - Hellens, R. P. AU - Putterill, J. AU - Stevenson, D. E. AU - Kutty-Amma, S. AU - Allan, A. C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Red colouration in apple fruit is due to the activity of the MYB transcription factor,MdMYB10 JO - Plant J VL - 49 ID - Espley2007 ER - TY - JOUR AU - Velasco, R. AU - Zharkikh, A. AU - Affourtit, J. AU - Dhingra, A. AU - Cestaro, A. AU - Kalyanaraman, A. AU - Fontana, P. AU - Bhatnagar, S. K. AU - Troggio, M. AU - Pruss, D. AU - Salvi, S. AU - Pindo, M. AU - Baldi, P. AU - Castelletti, S. AU - Cavaiuolo, M. AU - Coppola, G. AU - Costa, F. AU - Cova, V. AU - Dal Ri, A. AU - Goremykin, V. AU - Komjanc, M. AU - Longhi, S. AU - Magnago, P. AU - Malacarne, G. AU - Malnoy, M. AU - Micheletti, D. AU - Moretto, M. AU - Perazzolli, M. AU - Si-Ammour, A. AU - Vezzulli, S. AU - Zini, E. AU - Eldredge, G. AU - Fitzgerald, L. M. AU - Gutin, N. AU - Lanchbury, J. AU - Macalma, T. AU - Mitchell, J. T. AU - Reid, J. AU - Wardell, B. AU - Kodira, C. AU - Chen, Z. AU - Desany, B. AU - Niazi, F. AU - Palmer, M. AU - Koepke, T. AU - Jiwan, D. AU - Schaeffer, S. AU - Krishnan, V. AU - Wu, C. AU - Chu, V. T. AU - King, S. T. AU - Vick, J. AU - Tao, Q. AU - Mraz, A. AU - Stormo, A. AU - Stormo, K. AU - Bogden, R. AU - Ederle, D. AU - Stella, A. AU - Vecchietti, A. AU - Kater, M. M. AU - Masiero, S. AU - Lasserre, P. AU - Lespinasse, Y. AU - Allan, A. C. AU - Bus, V. AU - Chagné, D. AU - Crowhurst, R. N. AU - Gleave, A. P. AU - Lavezzo, E. AU - Fawcett, J. A. AU - Proost, S. AU - Rouzé, P. AU - Sterck, L. AU - Toppo, S. AU - Lazzari, B. AU - Hellens, R. P. AU - Durel, C. E. AU - Gutin, A. AU - Bumgarner, R. E. AU - Gardiner, S. E. AU - Skolnick, M. AU - Egholm, M. AU - Van de Peer, Y. AU - Salamini, F. AU - Viola, R. PY - 2010 DA - 2010// TI - The genome of the domesticated apple (Malusxdomestica) JO - Nat Genet VL - 42 ID - Velasco2010 ER - TY - CHAP AU - Bus, V. G. M. AU - Esmenjaud, D. AU - Buck, E. AU - Laurens, F. ED - Folta, K. M. ED - Gardiner, S. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Application of genetic markers in rosaceous crops BT - Genetics and Genomics of the Rosaceae PB - Springer CY - New York ID - Bus2009 ER - TY - JOUR AU - Chagné, D. AU - Carlisle, C. M. AU - Blond, C. AU - Volz, R. AU - Whitworth, C. J. AU - Oraguzie, N. C. AU - Crowhurst, R. N. AU - Allan, A. C. AU - Espley, R. V. AU - Hellens, R. P. AU - Gardiner, S. E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mapping a candidate gene (MDMYB10) for red flesh and foliage colour in apple JO - BMC Genomics VL - 8 ID - Chagné2007 ER - TY - CHAP AU - Peace, C. AU - Norelli, J. L. ED - Folta, K. M. ED - Gardiner, S. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genomics approaches to crop improvement in the Rosaceae BT - Genetics and Genomics of the Rosaceae PB - Springer CY - New York ID - Peace2009 ER - TY - JOUR AU - Chisholm, S. T. AU - Coaker, G. AU - Day, B. AU - Staskawica, B. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Host-microbe interactions: Shaping the evolution of the plant immune response JO - Cell VL - 124 ID - Chisholm2006 ER - TY - JOUR AU - Jones, J. D. G. AU - Dangl, J. L. PY - 2006 DA - 2006// TI - The plant immune system JO - Nature VL - 444 ID - Jones2006 ER - TY - JOUR AU - Thilmony, R. AU - Underwood, W. AU - He, S. Y. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genome-wide transcriptional analysis of the Arabidopsis thaliana interaction with the plant pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 and the human pathogen Escherichia coli O157:H7 JO - Plant J VL - 46 ID - Thilmony2006 ER - TY - JOUR AU - Truman, W. AU - Torres de Zabala, M. AU - Grant, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Type III effectors orchestrate a complex interplay between transcriptional networks to modify basal defence responses during pathogenesis and resistance JO - Plant J VL - 46 ID - Truman2006 ER - TY - JOUR AU - Norelli, J. L. AU - Farrell, R. E. AU - Bassett, C. L. AU - Baldo, A. M. AU - Lalli, D. A. AU - Aldwinckle, H. S. AU - Wisniewski, M. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Rapid transcriptional response of apple to fire blight disease revealed by cDNA suppression subtractive hybridization analysis JO - Tree Genet Genomes VL - 5 ID - Norelli2009 ER - TY - JOUR AU - Baldo, A. AU - Norelli, J. L. AU - Farrell, R. E. AU - Bassett, C. L. AU - Aldwinckle, H. S. AU - Malnoy, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Identification of genes differentially expressed during interaction of resistant and susceptible apple cultivars (Malusxdomestica) withErwinia amylovora JO - BMC Plant Biol VL - 10 ID - Baldo2010 ER - TY - JOUR AU - Newcomb, R. D. AU - Crowhurst, R. N. AU - Gleave, A. P. AU - Dickering, E. H. A. AU - Allan, A. C. AU - Beuning, L. L. AU - Bowen, J. H. AU - Gera, E. AU - Jamieson, K. R. AU - Janssen, B. J. AU - Laing, W. A. AU - McArtney, S. AU - Nain, B. AU - Ross, G. S. AU - Snowden, K. C. AU - Souleyre, E. J. AU - Walton, E. F. AU - Yauk, Y. K. PY - 2006 DA - 2006// TI - Analyses of expressed sequence tags from apple JO - Plant Physiol VL - 141 ID - Newcomb2006 ER - TY - JOUR AU - Bus, V. AU - Rikkerink, E. AU - Aldwinckle, H. S. AU - Caffier, V. AU - Durel, C. -. E. AU - Gardiner, S. AU - Gessler, C. AU - Groenwold, R. AU - Laurens, F. AU - Le Cam, B. AU - Luby, J. AU - Meulenbroek, B. AU - Kellerhals, M. AU - Parisi, L. AU - Patocchi, A. AU - Plummer, K. AU - Schouten, H. J. AU - Tartarini, S. AU - van de Weg, E. PY - 2009 DA - 2009// TI - A proposal for the nomenclature ofVenturia inaequalisraces JO - Acta Hort VL - 814 ID - Bus2009 ER - TY - JOUR AU - Gygax, M. AU - Gianfranceschi, L. AU - Liebhard, R. AU - Kellerhals, M. AU - Gessler, C. AU - Patocchi, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Molecular markers linked to the apple scab resistance geneVbjderived fromMalus baccata jackii JO - Theor Appl Genet VL - 109 ID - Gygax2004 ER - TY - JOUR AU - Vinatzer, B. A. AU - Patocchi, A. AU - Tartarini, S. AU - Gianfranceschi, L. AU - Sansavini, S. AU - Gessler, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - Isolation of two microsatellite markers from BAC clones of theVfscab resistance region and molecular characterization of scab-resistant accessions inMalusgermplasm JO - Plant Breed VL - 123 ID - Vinatzer2004 ER - TY - JOUR AU - Gasic, K. AU - Gonzalez, D. O. AU - Thimmapuram, J. AU - Liu, L. AU - Malnoy, M. AU - Gong, G. AU - Han, Y. AU - Vodkin, L. O. AU - Aldwinckle, H. S. AU - Carroll, N. J. AU - Orvis, K. S. AU - Goldsbrough, P. AU - Clifton, S. AU - Pape, D. AU - Fulton, L. AU - Martin, J. AU - Theising, B. AU - Wisniewski, M. E. AU - Fazio, G. AU - Feltus, F. A. AU - Korban, S. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Comparative analysis and functional annotation of a large expressed sequence tag collection of apple JO - Plant Genome VL - 2 ID - Gasic2009 ER - TY - JOUR AU - Celton, J. -. M. AU - Tustin, D. S. AU - Chagné, D. AU - Gardiner, S. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Construction of a dense genetic linkage map for apple rootstocks using SSRs developed fromMalusESTs andPyrusgenomic sequences JO - Tree Genet Genomes VL - 5 ID - Celton2009 ER - TY - JOUR AU - Chagné, D. AU - Gasic, K. AU - Crowhurst, R. N. AU - Han, Y. AU - Bassett, H. C. M. AU - Bowatte, D. R. AU - Lawrence, T. J. AU - Rikkerink, E. H. A. AU - Gardiner, S. E. AU - Korban, S. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Development of a set of SNP markers present in expressed genes of apple JO - Genomics VL - 92 ID - Chagné2008 ER - TY - JOUR AU - Lander, E. S. AU - Botstein PY - 1989 DA - 1989// TI - Mapping Mendelian factors underlying quantitative traits JO - Genetics VL - 121 ID - Lander1989 ER - TY - JOUR AU - Jansen, R. C. PY - 1993 DA - 1993// TI - Interval mapping of multiple quantitative trait loci JO - Genetics VL - 135 ID - Jansen1993 ER - TY - JOUR AU - Zeng, Z. PY - 1993 DA - 1993// TI - Theoretical basis for separation of multiple linked gene effects in mapping quantitative trait loci JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 90 ID - Zeng1993 ER - TY - STD TI - Main Bioinformatics Laboratory, Washington State University: Genome Database for the Rosaceae. Malus. Assembly V4 Project Description http://www.rosaceae.org/bio/content/?title=&url=%2Fcgi-bin%2Fgdr%2Fgdr_unigeneV4_project_description.cgi%3Fgenus%3Dmalus UR - http://www.rosaceae.org/bio/content/?title=&url=%2Fcgi-bin%2Fgdr%2Fgdr_unigeneV4_project_description.cgi%3Fgenus%3Dmalus ID - ref53 ER - TY - STD TI - The Institute for Genomic Research (TIGR) Plant Transcript Assemblies: J. Craig Venter Institute, Rockville MD and La Jolla CA. [http://plantta.jcvi.org/cgi-bin/plantta_release.pl] UR - http://plantta.jcvi.org/cgi-bin/plantta_release.pl ID - ref54 ER - TY - JOUR AU - Tognolli, M. AU - Penel, C. AU - Greppin, H. AU - Simon, P. PY - 2002 DA - 2002// TI - Analysis and expression of the class III peroxidase large gene family inArabidopsis thaliana JO - Gene VL - 288 ID - Tognolli2002 ER - TY - JOUR AU - Welinder, K. G. AU - Justesen, A. F. AU - Kjaersgård, I. V. H. AU - Jensen, R. B. AU - Rasmussen, S. K. AU - Jespersen, H. M. AU - Duroux, L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Structural diversity and transcription of class III peroxidases from Arabidopsis thaliana JO - Eur J Biochem VL - 269 ID - Welinder2002 ER - TY - JOUR AU - Passardi, F. AU - Longet, D. AU - Tenel, C. AU - Dunand, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - The class III peroxidase multigenic family in rice and its evolution in land plants JO - Phytochemistry VL - 65 ID - Passardi2004 ER - TY - JOUR AU - Bakalovic, N. AU - Passardi, F. AU - Ioannidis, V. AU - Cosio, C. AU - Penel, C. AU - Falquet, L. AU - Dunand, C. PY - 2006 DA - 2006// TI - PeroxiBase: A class III plant peroxidase database JO - Phytochemistry VL - 67 ID - Bakalovic2006 ER - TY - JOUR AU - Bindschedler, L. V. AU - Dewdney, J. AU - Blee, K. A. AU - Stone, J. M. AU - Asai, T. AU - Plotnikov, J. AU - Denoux, C. AU - Hayes, T. AU - Gerrish, C. AU - Davies, D. R. AU - Ausubel, F. M. AU - Bolwell, G. P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Peroxidase-dependent apoplastic oxidative burst in Arabidopsis required for pathogen resistance JO - Plant J VL - 47 ID - Bindschedler2006 ER - TY - JOUR AU - Johrde, A. AU - Schweizer, P. PY - 2008 DA - 2008// TI - A class III peroxidase specifically expressed in pathogen-attacked barley epidermis contributes to basal resistance JO - Mol Plant Pathol VL - 9 ID - Johrde2008 ER - TY - JOUR AU - Venisse, J. -. S. AU - Gullner, G. AU - Brisset, M. -. N. PY - 2001 DA - 2001// TI - Evidence for the involvement of an oxidative stress in the initiation of infection of pear byErwinia amylovora JO - Plant Physiol VL - 125 ID - Venisse2001 ER - TY - JOUR AU - Venisse, J. -. S. AU - Malnoy, M. AU - Faize, M. AU - Paulin, J. -. P. AU - Brisset, M. -. N. PY - 2002 DA - 2002// TI - Modulation of defense responses ofMalusspp. during compatible and incompatible interactions withErwinia amylovora JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 15 ID - Venisse2002 ER - TY - JOUR AU - Kobe, B. AU - Kajava, A. V. PY - 2001 DA - 2001// TI - The leucine-rich repeat as a protein recognition motif JO - Curr Opin Struct Biol VL - 11 ID - Kobe2001 ER - TY - JOUR AU - Kinoshita, T. AU - Caño-Delgado, A. AU - Seto, H. AU - Hiraruma, S. AU - Fujioka, S. AU - Yoshida, S. AU - Chory, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Binding of brassinosteroids to the extracellular domain of plant receptor kinase BRI1 JO - Plant J VL - 44 ID - Kinoshita2005 ER - TY - JOUR AU - Takken, F. L. W. AU - Tameling, W. I. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - To nibble at plant resistance proteins JO - Science VL - 324 ID - Takken2009 ER - TY - JOUR AU - Nürnberger, T. AU - Kemmerling, B. PY - 2006 DA - 2006// TI - Receptor protein kinases: pattern recognition receptors in plant immunity JO - Trends Plant Sci VL - 11 ID - Nürnberger2006 ER - TY - JOUR AU - Shiu, S. H. AU - Bleecker, A. B. PY - 2003 DA - 2003// TI - Expansion of the receptor-like kinase/Pelle gene family and receptor-like proteins in Arabidopsis JO - Plant Physiol VL - 132 ID - Shiu2003 ER - TY - JOUR AU - Kruijt, M. AU - De Kock, M. J. D. AU - de Wit, P. J. G. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Receptor-like proteins involved in plant disease resistance JO - Mol Plant Pathol VL - 6 ID - Kruijt2005 ER - TY - JOUR AU - Wang, G. AU - Ellendorff, U. AU - Kemp, B. AU - Mansfield, J. W. AU - Forsyth, A. AU - Mitchell, K. AU - Bastas, K. AU - Liu, C. -. M. AU - Woods-Tör, A. AU - Zipfel, C. AU - de Wit, P. J. G. M. AU - Jones, J. D. G. AU - Tör, M. AU - Thomma, B. P. H. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - A genome-wide functional investigation into the roles of receptor-like proteins inArabidopsis JO - Plant Physiol VL - 147 ID - Wang2008 ER - TY - JOUR AU - Nakai, K. AU - Horton, P. PY - 1999 DA - 1999// TI - PSORT: a program for detecting sorting signals in proteins and predicting their subcellular localization JO - Trends Biochem Sci VL - 24 ID - Nakai1999 ER - TY - JOUR AU - McGuffin, L. J. AU - Bryson, K. AU - Jones, D. T. PY - 2000 DA - 2000// TI - The PSIPRED protein structure prediction server JO - Bioinformatics VL - 16 ID - McGuffin2000 ER - TY - JOUR AU - Käll, L. AU - Krogh, A. AU - Sonnhammer, E. PY - 2005 DA - 2005// TI - An HMM posterior decoder for sequence feature prediction that includes homology information JO - Bioinformatics VL - 21 ID - Käll2005 ER - TY - STD TI - TMpred - Prediction of Transmembrane Regions and Orientation.[http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html], UR - http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html ID - ref73 ER - TY - JOUR AU - Nugent, T. AU - Jones, D. T. PY - 2009 DA - 2009// TI - Transmembrane protein topology prediction using support vector machines JO - BMC Bioinformatics VL - 10 ID - Nugent2009 ER - TY - JOUR AU - Jones, D. A. AU - Jones, J. D. G. PY - 1997 DA - 1997// TI - The role of leucine-rich repeat proteins in plant defences JO - Adv Bot Res VL - 24 ID - Jones1997 ER - TY - JOUR AU - Belfanti, E. AU - Silfverberg-Dilworth, E. AU - Tartarini, S. AU - Patocchi, A. AU - Barbieri, M. AU - Zhu, J. AU - Vinatzer, B. A. AU - Gainfranceschi, L. AU - Gessler, C. AU - Sansavini, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - TheHcrVf2gene from a wild apple confers scab resistance to a transgenic cultivated variety JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 101 ID - Belfanti2004 ER - TY - JOUR AU - Malnoy, M. AU - Xu, M. AU - Borejsza-Wysocka, E. AU - Korban, S. S. AU - Aldwinckle, H. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Two receptor-like genes,Vfa1andVfa2, confer resistance to the fungal pathogenVenturia inaequalisinciting apple scab disease JO - Mol Plant Microbe Interact VL - 21 ID - Malnoy2008 ER - TY - JOUR AU - Capriotti, E. AU - Fariselli, P. AU - Casadio, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - I-Mutant2.0: predicting stability changes upon mutation from the protein sequence or structure JO - Nucl Acids Res VL - 33 ID - Capriotti2005 ER - TY - JOUR AU - Bocsanczy, A. M. AU - Phillips, J. G. AU - Dardick, C. D. AU - Korban, S. S. AU - Bassett, C. L. AU - Wisniewski, M. E. AU - Norelli, J. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Analysis of apple (Malus) responses to bacterial pathogens using an oligo microarray [abstract] JO - Phytopathology VL - 99 ID - Bocsanczy2009 ER - TY - JOUR AU - Botër, M. AU - Amigues, B. AU - Peart, J. AU - Breuer, C. AU - Kadota, Y. AU - Casais, C. AU - Moore, G. AU - Kleanthous, C. AU - Ochsenbein, F. AU - Shirasu, K. AU - Guerois, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - Structural and functional analysis of SGT1 reveals that its interaction with HSP90 is required for the accumulation of Rx, and R protein involved in plant immunity JO - Plant Cell VL - 19 ID - Botër2007 ER - TY - JOUR AU - Hubert, D. A. AU - He, Y. AU - McNulty, B. C. AU - Tornero, P. AU - Dangl, J. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - SpecificArabidopsisHSP90.2 alleles recapitulate RAR1 cochaperone function in plant NB-LRR disease resistance protein regulation JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 106 ID - Hubert2009 ER - TY - JOUR AU - Hubert, D. A. AU - Tornero, P. AU - Belkhadir, Y. AU - Krishna, P. AU - Takahashi, A. AU - Shirasu, K. AU - DAngl, J. L. PY - 2003 DA - 2003// TI - Cytosolic HSP90 associates with and modulates theArabidopsisRPM1 disease resistance protein JO - EMBO J VL - 22 ID - Hubert2003 ER - TY - JOUR AU - Kawasaki, T. AU - Nam, J. AU - Boyes, D. C. AU - Holt, B. F. AU - Hubert, D. A. AU - Wiig, A. AU - Dangl, J. L. PY - 2005 DA - 2005// TI - A duplicated pair ofArabidopsisRING-finger E3 ligases contribute to the RPM1- and RPS2-mediated jypersensitive response JO - Plant J VL - 44 ID - Kawasaki2005 ER - TY - JOUR AU - Takahaski, A. AU - Casais, C. AU - Ichimura, K. AU - Shirasu, K. PY - 2003 DA - 2003// TI - HSP90 interacts with RAR1 and SGT1 and is essential for RSP2-mediated disease resistance inArabidopsis JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 100 ID - Takahaski2003 ER - TY - JOUR AU - Belkhadir, Y. AU - Nimchuk, Z. AU - Hubert, D. A. AU - Mackey, D. AU - Dangl, J. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - ArabidopsisRIN4 negatively regulates disease resistance mediated by RPS2 and RPM1 downstream or independent of the NDR1 signal modulator and is not required for the virulence functions of bacterial type III effectors AvrRpt2 or AvrRpm1 JO - Plant Cell VL - 16 ID - Belkhadir2004 ER - TY - JOUR AU - Mackey, D. AU - Holt, B. F. AU - Wiig, A. AU - Dangl, J. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - RIN4 interacts withPseudomonas syringaetype III effector molecules and is required for RPM1-mediated resistance inArabidopsis JO - Cell VL - 108 ID - Mackey2002 ER - TY - STD TI - Young JM, Fletcher MJ: International Collection of Micro-organisms from Plants, Catalogue Accessions 1–12989. Landcare Research, Auckland, NZ. [http://www.landcareresearch.co.nz/research/biosystematics/fungi/icmp97.pdf], UR - http://www.landcareresearch.co.nz/research/biosystematics/fungi/icmp97.pdf ID - ref87 ER - TY - JOUR AU - Fischer, M. AU - Fischer, C. PY - 1999 DA - 1999// TI - Evaluation ofMalusspecies and cultivars at the Fruit Genebank Dresden-Pillnitz and its use for apple resistance breeding JO - Genet Resour Crop Evol VL - 46 ID - Fischer1999 ER - TY - JOUR AU - Gharghani, A. AU - Zamani, Z. AU - Talaie, T. AU - Oraguzie, N. C. AU - Fattahi, R. AU - Hajnajari, H. AU - Wiedow, C. AU - Gardiner, S. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genetic identity and relationships of Iranian apple (MalusxdomesticaBorkh) cultivars and landraces, wildMalusspecies and representative old apple cultivars based on simple sequence repeat (SSR) marker analysis JO - Genet Resour Crop Evol VL - 56 ID - Gharghani2009 ER - TY - STD TI - Green P: Phred, Phrap, Consed. http://www.phrap.org/phredphrapconsed.html, UR - http://www.phrap.org/phredphrapconsed.html ID - ref90 ER - TY - CHAP AU - Mahalingam, R. AU - Gomez-Buitrago, A. M. AU - Eckardt, N. AU - Shah, N. AU - Guevara-DEarcia, A. AU - Day, P. AU - Raina, R. AU - Federoff, N. V. PY - 2003 DA - 2003// TI - Characterizing the stress/defense transcriptome of Arabidopsis BT - Genome Biology ID - Mahalingam2003 ER - TY - JOUR AU - Gianfranceschi, L. AU - Seglias, N. AU - Tarchini, R. AU - Komjanc, M. AU - Gessler, C. PY - 1998 DA - 1998// TI - Simple sequence repeats for the genetic analysis of apple JO - Theor Appl Genet VL - 96 ID - Gianfranceschi1998 ER - TY - STD TI - Van Ooijen JW, Voorrips E: JoinMap® 3.0, Software for the Calculation of Genetic Linkage Maps. Wageningen, the Netherlands: Plant Research International; 2001s ID - ref93 ER - TY - JOUR AU - Broman, K. W. AU - Wu, H. AU - Sen, S. AU - Churchill, G. PY - 2003 DA - 2003// TI - R/qtl: QTL mapping in experimental crosses JO - Bioinformatics VL - 19 ID - Broman2003 ER - TY - JOUR AU - Haley, C. AU - Knott, S. PY - 1992 DA - 1992// TI - A simple regression method for mapping quantitative trait loci in line crosses using flanking markers JO - Heredity VL - 69 ID - Haley1992 ER - TY - JOUR AU - Sen, S. AU - Churchill, G. PY - 2001 DA - 2001// TI - A statistical framework for quantitative trait mapping JO - Genetics VL - 159 ID - Sen2001 ER - TY - JOUR AU - Churchill, G. A. AU - Doerge, R. W. PY - 1994 DA - 1994// TI - Empirical threshold values for quantitative trait mapping JO - Genetics VL - 138 ID - Churchill1994 ER - TY - JOUR AU - Broman, K. W. PY - 2003 DA - 2003// TI - Mapping quantitative trait loci in the case of a spike in the phenotype distribution JO - Genetics VL - 163 ID - Broman2003 ER - TY - CHAP AU - Wan, Y. AU - Fazio, G. AU - Baldo, A. M. PY - 2007 DA - 2007// BT - A preliminary genetic map of apple rootstock. Plant Animal Genomes XV Conference [abstract] ID - Wan2007 ER - TY - JOUR AU - Hall, T. A. PY - 1999 DA - 1999// TI - BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT JO - Nucl Acids Symp Ser VL - 41 ID - Hall1999 ER - TY - JOUR AU - Larkin, M. A. AU - Blackshields, G. AU - Brown, N. P. AU - Chenna, R. AU - McGettigan, P. A. AU - McWilliam, H. AU - Valentin, F. AU - Wallace, I. M. AU - Wilm, A. AU - Lopez, R. AU - Thompson, J. D. AU - Gibson, T. J. AU - Higgins, D. G. PY - 2007 DA - 2007// TI - Clustal W and Clustal X version 2.0 JO - Bioinformatics VL - 23 ID - Larkin2007 ER - TY - JOUR AU - Nicot, N. AU - Hausman, J. -. F. AU - Hoffmann, L. AU - Evers, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Housekeeping gene selection for real-time RT-PCR normalization in potato during biotic and abiotic stress JO - J Exp Bot VL - 56 ID - Nicot2005 ER - TY - JOUR AU - Livak, K. J. AU - Schmittgen, T. D. PY - 2001 DA - 2001// TI - Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2-ΔΔCtmethod JO - Methods VL - 25 ID - Livak2001 ER - TY - STD TI - Troggio M, Gleave A, Salvi S, Chagné D, Cestaro AS, Kumar S, Crowhurst RN, Gardiner SE: Apple, from genome to breeding. Tree Genet Genomes. 10.1007/s11295-012-0492-9. ID - ref104 ER - TY - JOUR AU - Kajava, A. V. PY - 1998 DA - 1998// TI - Structural diversity of leucine-rich repeat proteins JO - J Mol Biol VL - 277 ID - Kajava1998 ER - TY - JOUR AU - Quamme, H. A. AU - Bonn, W. G. PY - 1981 DA - 1981// TI - Virulence ofErwinia amylovoraand its influence on the determination of fire blight resistance of pear cultivars and seedlings JO - Can J Plant Pathol VL - 3 ID - Quamme1981 ER - TY - JOUR AU - Richter, K. AU - Fischer, C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Stability of fire blight resistance in apple JO - Acta Hort VL - 590 ID - Richter2002 ER - TY - JOUR AU - Seemüller, E. A. AU - Beer, S. V. PY - 1976 DA - 1976// TI - Absence of cell wall polysaccharide degradation byErwinia amylovora JO - Phytopathology VL - 66 ID - Seemüller1976 ER - TY - JOUR AU - Norelli, J. L. AU - Aldwinckle, H. S. AU - Beer, S. V. PY - 1988 DA - 1988// TI - Virulence ofErwinia amylovorastrains toMalussp. Novole plants grown in vitro and in the greenhouse JO - Phytopathology VL - 78 ID - Norelli1988 ER -