Table 3 The empirical Bayesian estimates of the top 66 marker (main) effects and marker pair (epistatic) effects.

M3

M39

0.5519

0.7409

0.0476

52.60

0.0000

0.0648

M1

M26

0.4070

0.6365

0.0479

38.29

0.0000

0.0469

M7

M35

0.2960

-0.5417

0.0460

30.06

0.0000

0.0324

M1

M56

0.2342

-0.4832

0.0453

24.66

0.0000

0.0286

M1

M11

0.2163

0.4633

0.0446

23.42

0.0000

0.0263

M37

M59

0.1847

0.4280

0.0414

23.23

0.0000

0.0230

M7

M50

0.2234

-0.4710

0.0456

23.11

0.0000

0.0262

M1

M8

0.1722

-0.4127

0.0412

21.78

0.0000

0.0214

M4

M55

0.2026

-0.4468

0.0454

20.99

0.0000

0.0231

M8

M65

0.1768

0.4174

0.0436

19.87

0.0000

0.0223

M4

M22

0.1574

0.3950

0.0413

19.85

0.0000

0.0194

M11

M24

0.1484

0.3826

0.0414

18.51

0.0000

0.0189

M12

M42

0.1273

-0.3549

0.0385

18.39

0.0000

0.0157

M20

M24

0.1551

-0.3913

0.0426

18.32

0.0000

0.0194

M18

M80

0.1854

-0.4284

0.0475

17.67

0.0000

0.0215

M13

M34

0.1437

0.3772

0.0422

17.34

0.0000

0.0185

M13

M68

0.1175

0.3407

0.0387

16.82

0.0000

0.0156

M3

M70

0.1521

0.3866

0.0451

15.94

0.0000

0.0183

M5

M22

0.1252

0.3515

0.0418

15.37

0.0000

0.0153

M4

M79

0.1377

0.3681

0.0445

14.82

0.0000

0.0167

M4

M36

0.1016

0.3166

0.0395

13.91

0.0000

0.0120

M1

M16

0.1602

0.3975

0.0499

13.74

0.0000

0.0192

M8

M33

0.0941

-0.3046

0.0409

12.04

0.0000

0.0121

M2

M9

0.0920

0.3002

0.0434

10.37

0.0000

0.0105

M12

M24

0.0799

0.2789

0.0413

9.91

0.0000

0.0101

M27

M36

0.0748

0.2701

0.0420

8.97

0.0000

0.0094

M1

M45

0.0741

0.2695

0.0420

8.93

0.0000

0.0090

M33

M50

0.0682

0.2575

0.0435

7.61

0.0000

0.0087

M9

M19

0.0696

-0.2599

0.0443

7.46

0.0000

0.0089

M12

M71

0.0563

0.2338

0.0404

7.28

0.0000

0.0066

M8

M56

0.0630

0.2465

0.0434

7.01

0.0000

0.0077

M11

M26

0.0696

0.2596

0.0483

6.27

0.0000

0.0077

M7

M27

0.0702

-0.2605

0.0499

5.92

0.0000

0.0081

M1

M52

0.0558

-0.2322

0.0451

5.76

0.0000

0.0061

M28

M63

0.0500

0.2187

0.0437

5.43

0.0000

0.0061

M34

M38

0.0506

0.2203

0.0449

5.22

0.0000

0.0059

M53

M79

0.0520

-0.2232

0.0461

5.08

0.0000

0.0059

M39

M45

0.0495

0.2178

0.0451

5.05

0.0000

0.0055

M9

M80

0.0380

-0.1907

0.0407

4.76

0.0000

0.0043

M1

M17

0.0446

-0.2069

0.0442

4.75

0.0000

0.0051

M25

M80

0.0367

-0.1869

0.0411

4.48

0.0000

0.0042

M15

M21

0.0408

-0.1971

0.0449

4.18

0.0000

0.0051

M1

M22

0.0417

-0.1987

0.0471

3.86

0.0000

0.0050

M2

M10

0.0288

0.1643

0.0394

3.78

0.0000

0.0032

M5

M27

0.0330

-0.1769

0.0436

3.57

0.0001

0.0040

M14

M26

0.0347

-0.1810

0.0447

3.55

0.0001

0.0040

M5

M38

0.0232

-0.1454

0.0442

2.35

0.0010

0.0025

M11

M18

0.0217

-0.1408

0.0446

2.16

0.0016

0.0025

M2

M37

0.0240

-0.1480

0.0469

2.16

0.0016

0.0024

M13

M58

0.0193

0.1321

0.0428

2.07

0.0020

0.0023

M25

M53

0.0176

-0.1259

0.0421

1.94

0.0028

0.0019

M44

M80

0.0193

0.1305

0.0474

1.65

0.0059

0.0018

M22

M27

0.0132

-0.1074

0.0404

1.53

0.0079

0.0015

M10

M22

0.0136

0.1086

0.0411

1.51

0.0083

0.0016

M22

M24

0.0098

0.0921

0.0363

1.39

0.0112

0.0011

M1

M77

0.0135

-0.1061

0.0453

1.19

0.0193

0.0013

M71

M76

0.0105

-0.0930

0.0425

1.04

0.0288

0.0010

M29

M48

0.0071

0.0738

0.0415

0.68

0.0759

0.0007

M6

M67

0.0049

-0.0604

0.0364

0.60

0.0976

0.0005

M20

M45

0.0057

0.0639

0.0401

0.55

0.1114

0.0005

M1

M6

0.0037

-0.0509

0.0344

0.48

0.1385

0.0003

M22

M66

0.0035

0.0475

0.0359

0.38

0.1858

0.0003

M19

M47

0.0029

0.0419

0.0337

0.33

0.2141

0.0002

M50

M76

0.0027

0.0396

0.0338

0.30

0.2410

0.0002

M62

M68

0.0021

-0.0338

0.0316

0.25

0.2847

0.0002

M22

M23

0.0027

0.0375

0.0359

0.24

0.2964

0.0002