Identification of population substructure among Jews using STR markers and dependence on reference populations included

Listman, Jennifer B; Hasin, Deborah; Kranzler, Henry R; Malison, Robert T; Mutirangura, Apiwat; Sughondhabirom, Atapol; Aharonovich, Efrat; Spivak, Baruch; Gelernter, Joel

doi:10.1186/1471-2156-11-48

Table 3 Delta values for each population pair for each marker

From: Identification of population substructure among Jews using STR markers and dependence on reference populations included

	Delta values for each population pair
Locus	EJ/ANAJ	EJ/NAJ	EJ/AA	EJ/EA	AJ/ANAJ	AJ/NAJ	AJ/AA	AJ/EA	ANAJ/NAJ	ANAJ/AA	ANAJ/EA	NAJ/AA	NAJ/EA	AA/EA
CSF1PO	0.09	0.10	0.18	0.18	0.13	0.05	0.16	0.11	0.09	0.22	0.19	0.17	0.10	0.15
D2S1338	0.30	0.25	0.32	0.37	0.10	0.18	0.26	0.11	0.14	0.24	0.12	0.29	0.14	0.28
D3S1358	0.14	0.10	0.18	0.18	0.17	0.17	0.16	0.11	0.12	0.12	0.18	0.20	0.14	0.21
D5S818	0.22	0.11	0.21	0.13	0.15	0.12	0.18	0.12	0.21	0.20	0.24	0.17	0.14	0.18
D7S820	0.16	0.09	0.16	0.09	0.11	0.05	0.18	0.08	0.08	0.26	0.14	0.19	0.07	0.13
D8S1179	0.19	0.14	0.30	0.28	0.10	0.16	0.27	0.16	0.13	0.25	0.10	0.30	0.18	0.30
D13S317	0.23	0.12	0.18	0.19	0.05	0.17	0.33	0.11	0.13	0.33	0.10	0.22	0.08	0.22
D16S539	0.18	0.11	0.22	0.12	0.07	0.11	0.19	0.07	0.17	0.22	0.10	0.15	0.11	0.23
D18S51	0.28	0.28	0.29	0.22	0.12	0.18	0.40	0.19	0.15	0.40	0.19	0.43	0.20	0.24
D19S433	0.21	0.15	0.25	0.22	0.12	0.14	0.24	0.07	0.15	0.25	0.10	0.17	0.13	0.25
D21S11	0.30	0.26	0.34	0.41	0.22	0.13	0.28	0.23	0.16	0.26	0.25	0.29	0.21	0.21
FGA	0.24	0.19	0.20	0.20	0.13	0.13	0.27	0.10	0.19	0.35	0.17	0.20	0.15	0.27
TH01	0.26	0.19	0.19	0.20	0.05	0.19	0.36	0.13	0.17	0.33	0.10	0.29	0.13	0.24
TPOX	0.24	0.23	0.22	0.24	0.07	0.05	0.20	0.08	0.05	0.25	0.08	0.23	0.06	0.28
vWA	0.24	0.16	0.20	0.20	0.10	0.17	0.35	0.12	0.14	0.38	0.11	0.27	0.10	0.36
D17S799	0.35	0.42	0.24	0.45	0.14	0.12	0.52	0.19	0.10	0.41	0.21	0.49	0.12	0.51
D8S272	N/A	N/A	N/A	N/A	0.09	0.18	0.34	0.10	0.17	0.35	0.17	0.46	0.18	0.34
D7S640	0.35	0.36	0.42	0.41	0.15	0.15	0.40	0.17	0.16	0.43	0.20	0.32	0.19	0.35
D8S1827	0.21	0.21	0.36	0.20	0.09	0.09	0.42	0.11	0.03	0.50	0.18	0.50	0.17	0.38
D22S274	0.16	0.15	0.19	0.24	0.15	0.09	0.16	0.12	0.14	0.13	0.18	0.14	0.16	0.20
D5S407	0.20	0.18	0.27	0.31	0.08	0.14	0.34	0.18	0.17	0.35	0.20	0.26	0.18	0.32
D2S162	0.27	0.26	0.34	0.33	0.16	0.17	0.37	0.12	0.19	0.40	0.22	0.30	0.21	0.46
D10S197	0.34	0.32	0.31	0.26	0.13	0.22	0.26	0.15	0.11	0.30	0.11	0.31	0.09	0.23
D11S935	0.23	0.18	0.44	0.25	0.07	0.12	0.65	0.18	0.07	0.64	0.16	0.59	0.14	0.58
D9S175	0.33	0.30	0.50	0.34	0.17	0.13	0.46	0.13	0.17	0.54	0.19	0.49	0.12	0.49
D5S410	0.21	0.13	0.24	0.27	0.10	0.10	0.43	0.16	0.12	0.42	0.15	0.34	0.22	0.44
D7S2469	0.29	0.23	0.30	0.29	0.15	0.10	0.31	0.13	0.12	0.31	0.15	0.32	0.14	0.33
D16S3017	0.28	0.23	0.21	0.30	0.18	0.13	0.27	0.08	0.09	0.32	0.10	0.28	0.09	0.30
D10S1786	0.31	0.24	0.27	0.28	0.09	0.12	0.49	0.05	0.10	0.54	0.09	0.49	0.13	0.48
D15S1002	0.23	0.12	0.38	0.21	0.13	0.13	0.53	0.12	0.14	0.51	0.14	0.43	0.12	0.48
D6S1610	0.26	0.19	0.15	0.18	0.12	0.13	0.28	0.16	0.13	0.31	0.24	0.24	0.16	0.25
D1S2628	0.32	0.27	0.28	0.35	0.07	0.10	0.46	0.08	0.13	0.49	0.06	0.39	0.11	0.45
AVERAGE	0.25	0.20	0.27	0.25	0.12	0.13	0.33	0.13	0.13	0.34	0.15	0.31	0.14	0.32

Back to article page

ISSN: 2730-6844

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com

BMC Genomic Data

Contact us