Haplotype | Nucleotide position | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | atp B- rbc L | trn L- trn F | psb A- trn H | |||||||||||||||||||||||||||||||
 | 60 | 193 | 195 | 202 | 203 | 214 | 310 | 381 | 503 | 507 | 603 | 656 | 723 | 22 | 177 | 264 | 265 | 463 | 484 | 726 | 48 | 73 | 151 | 188 | 212 | 236 | 260 | 295 | 326 | 366 | 379 | 435 | 447 | 451 |
HapA | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | C | C | G | - | - | - | - | - | - | - | G | § | - | T | A |
HapB | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapC | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | A |
HapD | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | G | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapE | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | - | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | A |
HapF | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | ¶ | ¶ | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapG | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapH | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | ¶ | ¶ | ¶ | ¶ | - | A | G | § | - | T | T |
HapI | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | A | § | - | T | T |
hapJ | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | ¶ | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapK | C | C | T | T | - | - | C | G | C | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | A |
HapL | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | A | § | - | T | T |
HapM | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | - | - | - | A | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | G | T |
HapN | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | A | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapO | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapP | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | T | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapQ | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | G | T |
HapR | C | C | T | T | - | T | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | A |
HapS | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | A |
HapT | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | - | - | - | A | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapU | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | # | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapV | C | C | T | - | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapW | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | - | - | - | A | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | G | T |
HapX | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | - | - | - | A | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
HapY | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | - | - | - | A | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | A | § | - | T | T |
HapZ1 | T | C | C | T | - | T | C | A | A | T | C | A | T | - | - | - | - | - | A | A | C | T | - | - | - | - | - | - | A | G | - | £ | G | T |
HapZ2 | T | C | C | T | - | T | C | A | A | T | C | A | T | - | - | A | - | - | C | A | C | T | - | - | - | - | - | - | A | G | - | £ | G | T |
Hap1 | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | A | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
Hap2 | C | T | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
Hap3 | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | T | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
Hap4 | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | * | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | G | § | - | T | T |
Hap5 | C | C | T | T | - | - | C | G | A | C | T | G | T | * | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | A | § | - | T | T |
Hap6 | C | C | T | T | T | - | C | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | - | A | A | § | - | T | T |
Hap7 | C | C | T | T | - | - | G | G | A | C | T | G | T | - | - | A | - | - | C | A | C | G | - | - | - | - | - | ‡ | A | G | § | - | T | T |